Protein–RNA interactions for Protein: A6NFU0

FAM187A, Ig-like V-type domain-containing protein FAM187A, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187AA6NFU0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM187AA6NFU0 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM187AA6NFU0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM187AA6NFU0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM187AA6NFU0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM187AA6NFU0 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM187AA6NFU0 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM187AA6NFU0 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM187AA6NFU0 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
FAM187AA6NFU0 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM187AA6NFU0 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM187AA6NFU0 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM187AA6NFU0 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM187AA6NFU0 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM187AA6NFU0 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM187AA6NFU0 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM187AA6NFU0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM187AA6NFU0 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM187AA6NFU0 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM187AA6NFU0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM187AA6NFU0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM187AA6NFU0 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM187AA6NFU0 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM187AA6NFU0 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM187AA6NFU0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM187AA6NFU0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM187AA6NFU0 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM187AA6NFU0 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM187AA6NFU0 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM187AA6NFU0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM187AA6NFU0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM187AA6NFU0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM187AA6NFU0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM187AA6NFU0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FAM187AA6NFU0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FAM187AA6NFU0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FAM187AA6NFU0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FAM187AA6NFU0 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM187AA6NFU0 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM187AA6NFU0 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM187AA6NFU0 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM187AA6NFU0 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM187AA6NFU0 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM187AA6NFU0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM187AA6NFU0 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM187AA6NFU0 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM187AA6NFU0 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM187AA6NFU0 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM187AA6NFU0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM187AA6NFU0 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM187AA6NFU0 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM187AA6NFU0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM187AA6NFU0 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM187AA6NFU0 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM187AA6NFU0 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM187AA6NFU0 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM187AA6NFU0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM187AA6NFU0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM187AA6NFU0 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM187AA6NFU0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM187AA6NFU0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM187AA6NFU0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM187AA6NFU0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM187AA6NFU0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM187AA6NFU0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM187AA6NFU0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM187AA6NFU0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM187AA6NFU0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM187AA6NFU0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM187AA6NFU0 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM187AA6NFU0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM187AA6NFU0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM187AA6NFU0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM187AA6NFU0 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM187AA6NFU0 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM187AA6NFU0 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM187AA6NFU0 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM187AA6NFU0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM187AA6NFU0 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM187AA6NFU0 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM187AA6NFU0 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM187AA6NFU0 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM187AA6NFU0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM187AA6NFU0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM187AA6NFU0 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM187AA6NFU0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM187AA6NFU0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM187AA6NFU0 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM187AA6NFU0 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM187AA6NFU0 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM187AA6NFU0 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM187AA6NFU0 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM187AA6NFU0 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM187AA6NFU0 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM187AA6NFU0 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM187AA6NFU0 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM187AA6NFU0 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM187AA6NFU0 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM187AA6NFU0 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM187AA6NFU0 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms