Protein–RNA interactions for Protein: A6NFR6

C5orf60, Putative uncharacterized protein C5orf60, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf60A6NFR6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C5orf60A6NFR6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C5orf60A6NFR6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C5orf60A6NFR6 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C5orf60A6NFR6 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
C5orf60A6NFR6 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C5orf60A6NFR6 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C5orf60A6NFR6 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C5orf60A6NFR6 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C5orf60A6NFR6 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C5orf60A6NFR6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C5orf60A6NFR6 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C5orf60A6NFR6 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C5orf60A6NFR6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C5orf60A6NFR6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C5orf60A6NFR6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C5orf60A6NFR6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C5orf60A6NFR6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C5orf60A6NFR6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C5orf60A6NFR6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C5orf60A6NFR6 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C5orf60A6NFR6 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C5orf60A6NFR6 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C5orf60A6NFR6 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C5orf60A6NFR6 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C5orf60A6NFR6 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C5orf60A6NFR6 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C5orf60A6NFR6 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C5orf60A6NFR6 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C5orf60A6NFR6 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C5orf60A6NFR6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C5orf60A6NFR6 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C5orf60A6NFR6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C5orf60A6NFR6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C5orf60A6NFR6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C5orf60A6NFR6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C5orf60A6NFR6 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
C5orf60A6NFR6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C5orf60A6NFR6 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C5orf60A6NFR6 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.11
C5orf60A6NFR6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
C5orf60A6NFR6 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C5orf60A6NFR6 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C5orf60A6NFR6 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C5orf60A6NFR6 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C5orf60A6NFR6 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C5orf60A6NFR6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C5orf60A6NFR6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
C5orf60A6NFR6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C5orf60A6NFR6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C5orf60A6NFR6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C5orf60A6NFR6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C5orf60A6NFR6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C5orf60A6NFR6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C5orf60A6NFR6 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
C5orf60A6NFR6 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C5orf60A6NFR6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C5orf60A6NFR6 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C5orf60A6NFR6 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
C5orf60A6NFR6 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C5orf60A6NFR6 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C5orf60A6NFR6 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C5orf60A6NFR6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C5orf60A6NFR6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C5orf60A6NFR6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
C5orf60A6NFR6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
C5orf60A6NFR6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C5orf60A6NFR6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
C5orf60A6NFR6 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
C5orf60A6NFR6 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C5orf60A6NFR6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
C5orf60A6NFR6 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
C5orf60A6NFR6 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C5orf60A6NFR6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C5orf60A6NFR6 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C5orf60A6NFR6 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C5orf60A6NFR6 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C5orf60A6NFR6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C5orf60A6NFR6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C5orf60A6NFR6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C5orf60A6NFR6 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C5orf60A6NFR6 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C5orf60A6NFR6 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C5orf60A6NFR6 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C5orf60A6NFR6 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C5orf60A6NFR6 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C5orf60A6NFR6 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C5orf60A6NFR6 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C5orf60A6NFR6 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
C5orf60A6NFR6 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C5orf60A6NFR6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C5orf60A6NFR6 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C5orf60A6NFR6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C5orf60A6NFR6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C5orf60A6NFR6 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C5orf60A6NFR6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C5orf60A6NFR6 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C5orf60A6NFR6 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C5orf60A6NFR6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C5orf60A6NFR6 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms