Protein–RNA interactions for Protein: A6NEY3

GOLGA6L3, Putative golgin subfamily A member 6-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L3A6NEY3 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GOLGA6L3A6NEY3 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GOLGA6L3A6NEY3 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GOLGA6L3A6NEY3 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GOLGA6L3A6NEY3 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GOLGA6L3A6NEY3 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GOLGA6L3A6NEY3 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GOLGA6L3A6NEY3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GOLGA6L3A6NEY3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GOLGA6L3A6NEY3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GOLGA6L3A6NEY3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GOLGA6L3A6NEY3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GOLGA6L3A6NEY3 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GOLGA6L3A6NEY3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GOLGA6L3A6NEY3 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GOLGA6L3A6NEY3 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GOLGA6L3A6NEY3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GOLGA6L3A6NEY3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GOLGA6L3A6NEY3 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GOLGA6L3A6NEY3 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GOLGA6L3A6NEY3 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GOLGA6L3A6NEY3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GOLGA6L3A6NEY3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GOLGA6L3A6NEY3 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GOLGA6L3A6NEY3 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GOLGA6L3A6NEY3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GOLGA6L3A6NEY3 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GOLGA6L3A6NEY3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GOLGA6L3A6NEY3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GOLGA6L3A6NEY3 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GOLGA6L3A6NEY3 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GOLGA6L3A6NEY3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GOLGA6L3A6NEY3 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GOLGA6L3A6NEY3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GOLGA6L3A6NEY3 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GOLGA6L3A6NEY3 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GOLGA6L3A6NEY3 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GOLGA6L3A6NEY3 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GOLGA6L3A6NEY3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GOLGA6L3A6NEY3 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GOLGA6L3A6NEY3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GOLGA6L3A6NEY3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GOLGA6L3A6NEY3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GOLGA6L3A6NEY3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GOLGA6L3A6NEY3 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GOLGA6L3A6NEY3 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GOLGA6L3A6NEY3 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GOLGA6L3A6NEY3 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GOLGA6L3A6NEY3 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GOLGA6L3A6NEY3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GOLGA6L3A6NEY3 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GOLGA6L3A6NEY3 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GOLGA6L3A6NEY3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GOLGA6L3A6NEY3 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GOLGA6L3A6NEY3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GOLGA6L3A6NEY3 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GOLGA6L3A6NEY3 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GOLGA6L3A6NEY3 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GOLGA6L3A6NEY3 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GOLGA6L3A6NEY3 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GOLGA6L3A6NEY3 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
GOLGA6L3A6NEY3 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GOLGA6L3A6NEY3 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GOLGA6L3A6NEY3 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GOLGA6L3A6NEY3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GOLGA6L3A6NEY3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GOLGA6L3A6NEY3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GOLGA6L3A6NEY3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GOLGA6L3A6NEY3 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GOLGA6L3A6NEY3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GOLGA6L3A6NEY3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GOLGA6L3A6NEY3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GOLGA6L3A6NEY3 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GOLGA6L3A6NEY3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GOLGA6L3A6NEY3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GOLGA6L3A6NEY3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GOLGA6L3A6NEY3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GOLGA6L3A6NEY3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GOLGA6L3A6NEY3 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GOLGA6L3A6NEY3 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GOLGA6L3A6NEY3 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GOLGA6L3A6NEY3 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GOLGA6L3A6NEY3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GOLGA6L3A6NEY3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GOLGA6L3A6NEY3 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GOLGA6L3A6NEY3 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
GOLGA6L3A6NEY3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
GOLGA6L3A6NEY3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GOLGA6L3A6NEY3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GOLGA6L3A6NEY3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GOLGA6L3A6NEY3 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GOLGA6L3A6NEY3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GOLGA6L3A6NEY3 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GOLGA6L3A6NEY3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GOLGA6L3A6NEY3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GOLGA6L3A6NEY3 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GOLGA6L3A6NEY3 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GOLGA6L3A6NEY3 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GOLGA6L3A6NEY3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GOLGA6L3A6NEY3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms