Protein–RNA interactions for Protein: A4FU28

CTAGE9, cTAGE family member 9, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTAGE9A4FU28 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTAGE9A4FU28 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CTAGE9A4FU28 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTAGE9A4FU28 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTAGE9A4FU28 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTAGE9A4FU28 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTAGE9A4FU28 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTAGE9A4FU28 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTAGE9A4FU28 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTAGE9A4FU28 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTAGE9A4FU28 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTAGE9A4FU28 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTAGE9A4FU28 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTAGE9A4FU28 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CTAGE9A4FU28 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CTAGE9A4FU28 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTAGE9A4FU28 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTAGE9A4FU28 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTAGE9A4FU28 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTAGE9A4FU28 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTAGE9A4FU28 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTAGE9A4FU28 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTAGE9A4FU28 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTAGE9A4FU28 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTAGE9A4FU28 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTAGE9A4FU28 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTAGE9A4FU28 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTAGE9A4FU28 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTAGE9A4FU28 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTAGE9A4FU28 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTAGE9A4FU28 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTAGE9A4FU28 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTAGE9A4FU28 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTAGE9A4FU28 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTAGE9A4FU28 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTAGE9A4FU28 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTAGE9A4FU28 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTAGE9A4FU28 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTAGE9A4FU28 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTAGE9A4FU28 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTAGE9A4FU28 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTAGE9A4FU28 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTAGE9A4FU28 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTAGE9A4FU28 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTAGE9A4FU28 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTAGE9A4FU28 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTAGE9A4FU28 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTAGE9A4FU28 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTAGE9A4FU28 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTAGE9A4FU28 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTAGE9A4FU28 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CTAGE9A4FU28 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CTAGE9A4FU28 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTAGE9A4FU28 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTAGE9A4FU28 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTAGE9A4FU28 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTAGE9A4FU28 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTAGE9A4FU28 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTAGE9A4FU28 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTAGE9A4FU28 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTAGE9A4FU28 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTAGE9A4FU28 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTAGE9A4FU28 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTAGE9A4FU28 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTAGE9A4FU28 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTAGE9A4FU28 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTAGE9A4FU28 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CTAGE9A4FU28 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTAGE9A4FU28 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTAGE9A4FU28 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTAGE9A4FU28 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTAGE9A4FU28 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTAGE9A4FU28 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTAGE9A4FU28 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTAGE9A4FU28 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTAGE9A4FU28 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTAGE9A4FU28 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTAGE9A4FU28 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CTAGE9A4FU28 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTAGE9A4FU28 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTAGE9A4FU28 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTAGE9A4FU28 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTAGE9A4FU28 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CTAGE9A4FU28 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTAGE9A4FU28 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTAGE9A4FU28 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTAGE9A4FU28 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTAGE9A4FU28 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTAGE9A4FU28 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTAGE9A4FU28 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTAGE9A4FU28 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTAGE9A4FU28 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTAGE9A4FU28 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTAGE9A4FU28 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTAGE9A4FU28 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTAGE9A4FU28 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTAGE9A4FU28 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTAGE9A4FU28 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTAGE9A4FU28 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTAGE9A4FU28 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms