Protein–RNA interactions for Protein: A4D174

C7orf71, Putative uncharacterized protein C7orf71, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C7orf71A4D174 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C7orf71A4D174 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C7orf71A4D174 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C7orf71A4D174 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C7orf71A4D174 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C7orf71A4D174 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C7orf71A4D174 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C7orf71A4D174 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C7orf71A4D174 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C7orf71A4D174 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C7orf71A4D174 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C7orf71A4D174 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C7orf71A4D174 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
C7orf71A4D174 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C7orf71A4D174 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C7orf71A4D174 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C7orf71A4D174 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C7orf71A4D174 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C7orf71A4D174 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C7orf71A4D174 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C7orf71A4D174 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C7orf71A4D174 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C7orf71A4D174 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C7orf71A4D174 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C7orf71A4D174 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C7orf71A4D174 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
C7orf71A4D174 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C7orf71A4D174 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C7orf71A4D174 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C7orf71A4D174 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C7orf71A4D174 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C7orf71A4D174 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C7orf71A4D174 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C7orf71A4D174 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C7orf71A4D174 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C7orf71A4D174 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C7orf71A4D174 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C7orf71A4D174 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C7orf71A4D174 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C7orf71A4D174 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C7orf71A4D174 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C7orf71A4D174 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C7orf71A4D174 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C7orf71A4D174 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C7orf71A4D174 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
C7orf71A4D174 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
C7orf71A4D174 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
C7orf71A4D174 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
C7orf71A4D174 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C7orf71A4D174 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C7orf71A4D174 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C7orf71A4D174 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C7orf71A4D174 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C7orf71A4D174 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C7orf71A4D174 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C7orf71A4D174 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C7orf71A4D174 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C7orf71A4D174 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C7orf71A4D174 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
C7orf71A4D174 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C7orf71A4D174 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C7orf71A4D174 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C7orf71A4D174 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C7orf71A4D174 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C7orf71A4D174 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C7orf71A4D174 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C7orf71A4D174 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C7orf71A4D174 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C7orf71A4D174 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C7orf71A4D174 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C7orf71A4D174 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C7orf71A4D174 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C7orf71A4D174 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C7orf71A4D174 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C7orf71A4D174 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C7orf71A4D174 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C7orf71A4D174 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C7orf71A4D174 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C7orf71A4D174 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C7orf71A4D174 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C7orf71A4D174 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C7orf71A4D174 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
C7orf71A4D174 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
C7orf71A4D174 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C7orf71A4D174 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
C7orf71A4D174 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C7orf71A4D174 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C7orf71A4D174 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C7orf71A4D174 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C7orf71A4D174 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C7orf71A4D174 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C7orf71A4D174 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
C7orf71A4D174 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C7orf71A4D174 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C7orf71A4D174 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C7orf71A4D174 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C7orf71A4D174 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C7orf71A4D174 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C7orf71A4D174 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C7orf71A4D174 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms