Protein–RNA interactions for Protein: A2VCL2

CCDC162P, Coiled-coil domain-containing protein 162, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC162PA2VCL2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC162PA2VCL2 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC162PA2VCL2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC162PA2VCL2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC162PA2VCL2 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC162PA2VCL2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC162PA2VCL2 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC162PA2VCL2 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC162PA2VCL2 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC162PA2VCL2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC162PA2VCL2 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC162PA2VCL2 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC162PA2VCL2 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC162PA2VCL2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC162PA2VCL2 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC162PA2VCL2 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC162PA2VCL2 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC162PA2VCL2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC162PA2VCL2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC162PA2VCL2 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC162PA2VCL2 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC162PA2VCL2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC162PA2VCL2 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC162PA2VCL2 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC162PA2VCL2 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC162PA2VCL2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC162PA2VCL2 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC162PA2VCL2 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC162PA2VCL2 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC162PA2VCL2 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC162PA2VCL2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC162PA2VCL2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC162PA2VCL2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC162PA2VCL2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC162PA2VCL2 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC162PA2VCL2 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.33■■□□□ 1
CCDC162PA2VCL2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC162PA2VCL2 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC162PA2VCL2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC162PA2VCL2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC162PA2VCL2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC162PA2VCL2 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC162PA2VCL2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC162PA2VCL2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC162PA2VCL2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC162PA2VCL2 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC162PA2VCL2 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC162PA2VCL2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC162PA2VCL2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC162PA2VCL2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC162PA2VCL2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC162PA2VCL2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC162PA2VCL2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC162PA2VCL2 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCDC162PA2VCL2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC162PA2VCL2 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC162PA2VCL2 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC162PA2VCL2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC162PA2VCL2 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC162PA2VCL2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC162PA2VCL2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC162PA2VCL2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC162PA2VCL2 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC162PA2VCL2 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC162PA2VCL2 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC162PA2VCL2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC162PA2VCL2 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC162PA2VCL2 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC162PA2VCL2 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC162PA2VCL2 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC162PA2VCL2 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC162PA2VCL2 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC162PA2VCL2 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC162PA2VCL2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCDC162PA2VCL2 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC162PA2VCL2 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC162PA2VCL2 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC162PA2VCL2 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC162PA2VCL2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC162PA2VCL2 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC162PA2VCL2 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCDC162PA2VCL2 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC162PA2VCL2 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC162PA2VCL2 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC162PA2VCL2 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC162PA2VCL2 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC162PA2VCL2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC162PA2VCL2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC162PA2VCL2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCDC162PA2VCL2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC162PA2VCL2 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC162PA2VCL2 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC162PA2VCL2 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC162PA2VCL2 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCDC162PA2VCL2 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC162PA2VCL2 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC162PA2VCL2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC162PA2VCL2 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC162PA2VCL2 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC162PA2VCL2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms