Protein–RNA interactions for Protein: A2RU54

HMX2, Homeobox protein HMX2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX2A2RU54 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HMX2A2RU54 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HMX2A2RU54 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HMX2A2RU54 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HMX2A2RU54 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HMX2A2RU54 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HMX2A2RU54 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HMX2A2RU54 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HMX2A2RU54 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HMX2A2RU54 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HMX2A2RU54 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HMX2A2RU54 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HMX2A2RU54 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HMX2A2RU54 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HMX2A2RU54 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HMX2A2RU54 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HMX2A2RU54 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HMX2A2RU54 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HMX2A2RU54 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HMX2A2RU54 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HMX2A2RU54 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HMX2A2RU54 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HMX2A2RU54 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HMX2A2RU54 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HMX2A2RU54 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HMX2A2RU54 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HMX2A2RU54 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HMX2A2RU54 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HMX2A2RU54 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HMX2A2RU54 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HMX2A2RU54 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HMX2A2RU54 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HMX2A2RU54 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HMX2A2RU54 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HMX2A2RU54 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HMX2A2RU54 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HMX2A2RU54 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HMX2A2RU54 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
HMX2A2RU54 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
HMX2A2RU54 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HMX2A2RU54 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HMX2A2RU54 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HMX2A2RU54 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HMX2A2RU54 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
HMX2A2RU54 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HMX2A2RU54 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HMX2A2RU54 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HMX2A2RU54 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HMX2A2RU54 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HMX2A2RU54 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
HMX2A2RU54 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HMX2A2RU54 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HMX2A2RU54 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
HMX2A2RU54 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HMX2A2RU54 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HMX2A2RU54 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HMX2A2RU54 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HMX2A2RU54 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HMX2A2RU54 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HMX2A2RU54 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HMX2A2RU54 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HMX2A2RU54 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HMX2A2RU54 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HMX2A2RU54 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HMX2A2RU54 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HMX2A2RU54 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HMX2A2RU54 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HMX2A2RU54 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HMX2A2RU54 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HMX2A2RU54 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HMX2A2RU54 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HMX2A2RU54 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HMX2A2RU54 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HMX2A2RU54 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HMX2A2RU54 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HMX2A2RU54 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HMX2A2RU54 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HMX2A2RU54 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HMX2A2RU54 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HMX2A2RU54 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HMX2A2RU54 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HMX2A2RU54 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HMX2A2RU54 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HMX2A2RU54 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HMX2A2RU54 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HMX2A2RU54 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HMX2A2RU54 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
HMX2A2RU54 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
HMX2A2RU54 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HMX2A2RU54 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HMX2A2RU54 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HMX2A2RU54 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HMX2A2RU54 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HMX2A2RU54 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
HMX2A2RU54 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HMX2A2RU54 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HMX2A2RU54 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HMX2A2RU54 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HMX2A2RU54 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HMX2A2RU54 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms