Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YY99

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0J9YY99 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A0A0J9YY99 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A0A0J9YY99 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A0A0J9YY99 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A0A0J9YY99 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
A0A0J9YY99 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A0A0J9YY99 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A0A0J9YY99 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A0A0J9YY99 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
A0A0J9YY99 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
A0A0J9YY99 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A0J9YY99 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A0J9YY99 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A0J9YY99 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A0J9YY99 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A0J9YY99 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A0J9YY99 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A0J9YY99 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A0J9YY99 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A0J9YY99 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A0J9YY99 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A0J9YY99 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A0J9YY99 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A0J9YY99 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A0J9YY99 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A0J9YY99 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A0J9YY99 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A0J9YY99 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A0J9YY99 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A0J9YY99 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A0J9YY99 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A0J9YY99 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A0J9YY99 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A0J9YY99 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A0J9YY99 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A0J9YY99 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A0J9YY99 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A0J9YY99 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A0J9YY99 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A0J9YY99 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A0J9YY99 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A0J9YY99 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A0J9YY99 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A0J9YY99 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A0J9YY99 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A0J9YY99 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A0J9YY99 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A0J9YY99 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A0J9YY99 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A0J9YY99 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A0J9YY99 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A0J9YY99 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A0J9YY99 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A0J9YY99 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A0J9YY99 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A0J9YY99 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A0J9YY99 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A0J9YY99 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A0J9YY99 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A0J9YY99 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A0J9YY99 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A0J9YY99 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A0J9YY99 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A0J9YY99 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A0J9YY99 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A0J9YY99 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A0J9YY99 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A0J9YY99 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A0J9YY99 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A0J9YY99 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A0J9YY99 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A0J9YY99 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A0J9YY99 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A0J9YY99 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A0J9YY99 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A0J9YY99 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A0J9YY99 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A0J9YY99 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A0J9YY99 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A0J9YY99 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A0J9YY99 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A0J9YY99 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A0J9YY99 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A0J9YY99 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A0J9YY99 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A0J9YY99 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A0J9YY99 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A0J9YY99 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A0J9YY99 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A0J9YY99 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A0J9YY99 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A0J9YY99 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A0J9YY99 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A0J9YY99 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A0J9YY99 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A0J9YY99 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A0J9YY99 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A0J9YY99 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A0J9YY99 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A0J9YY99 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms