Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R9

CCDC61, Coiled-coil domain-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC61Q9Y6R9 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC61Q9Y6R9 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC61Q9Y6R9 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC61Q9Y6R9 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC61Q9Y6R9 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC61Q9Y6R9 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC61Q9Y6R9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC61Q9Y6R9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC61Q9Y6R9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC61Q9Y6R9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC61Q9Y6R9 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC61Q9Y6R9 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC61Q9Y6R9 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC61Q9Y6R9 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC61Q9Y6R9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC61Q9Y6R9 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC61Q9Y6R9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC61Q9Y6R9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC61Q9Y6R9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC61Q9Y6R9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC61Q9Y6R9 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC61Q9Y6R9 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC61Q9Y6R9 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC61Q9Y6R9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC61Q9Y6R9 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC61Q9Y6R9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC61Q9Y6R9 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC61Q9Y6R9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC61Q9Y6R9 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC61Q9Y6R9 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC61Q9Y6R9 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC61Q9Y6R9 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC61Q9Y6R9 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC61Q9Y6R9 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC61Q9Y6R9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC61Q9Y6R9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC61Q9Y6R9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC61Q9Y6R9 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC61Q9Y6R9 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC61Q9Y6R9 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC61Q9Y6R9 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC61Q9Y6R9 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC61Q9Y6R9 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC61Q9Y6R9 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC61Q9Y6R9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC61Q9Y6R9 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC61Q9Y6R9 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC61Q9Y6R9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC61Q9Y6R9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC61Q9Y6R9 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC61Q9Y6R9 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC61Q9Y6R9 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC61Q9Y6R9 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC61Q9Y6R9 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC61Q9Y6R9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC61Q9Y6R9 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC61Q9Y6R9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC61Q9Y6R9 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC61Q9Y6R9 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC61Q9Y6R9 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC61Q9Y6R9 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC61Q9Y6R9 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC61Q9Y6R9 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC61Q9Y6R9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CCDC61Q9Y6R9 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CCDC61Q9Y6R9 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
CCDC61Q9Y6R9 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CCDC61Q9Y6R9 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.3
CCDC61Q9Y6R9 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC61Q9Y6R9 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC61Q9Y6R9 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC61Q9Y6R9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC61Q9Y6R9 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC61Q9Y6R9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC61Q9Y6R9 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC61Q9Y6R9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC61Q9Y6R9 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC61Q9Y6R9 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC61Q9Y6R9 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC61Q9Y6R9 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC61Q9Y6R9 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC61Q9Y6R9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC61Q9Y6R9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC61Q9Y6R9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC61Q9Y6R9 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC61Q9Y6R9 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC61Q9Y6R9 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC61Q9Y6R9 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC61Q9Y6R9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC61Q9Y6R9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC61Q9Y6R9 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC61Q9Y6R9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC61Q9Y6R9 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC61Q9Y6R9 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC61Q9Y6R9 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC61Q9Y6R9 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC61Q9Y6R9 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC61Q9Y6R9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC61Q9Y6R9 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC61Q9Y6R9 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms