Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
MAP3K4Q9Y6R4 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
MAP3K4Q9Y6R4 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
MAP3K4Q9Y6R4 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC33.18■■■□□ 2.9
MAP3K4Q9Y6R4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
MAP3K4Q9Y6R4 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
MAP3K4Q9Y6R4 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
MAP3K4Q9Y6R4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
MAP3K4Q9Y6R4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
MAP3K4Q9Y6R4 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
MAP3K4Q9Y6R4 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
MAP3K4Q9Y6R4 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
MAP3K4Q9Y6R4 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
MAP3K4Q9Y6R4 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC33.17■■■□□ 2.9
MAP3K4Q9Y6R4 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
MAP3K4Q9Y6R4 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
MAP3K4Q9Y6R4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
MAP3K4Q9Y6R4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
MAP3K4Q9Y6R4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
MAP3K4Q9Y6R4 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
MAP3K4Q9Y6R4 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
MAP3K4Q9Y6R4 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
MAP3K4Q9Y6R4 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
MAP3K4Q9Y6R4 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
MAP3K4Q9Y6R4 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC33.17■■■□□ 2.9
MAP3K4Q9Y6R4 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
MAP3K4Q9Y6R4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
MAP3K4Q9Y6R4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
MAP3K4Q9Y6R4 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
MAP3K4Q9Y6R4 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
MAP3K4Q9Y6R4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
MAP3K4Q9Y6R4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
MAP3K4Q9Y6R4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
MAP3K4Q9Y6R4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
MAP3K4Q9Y6R4 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
MAP3K4Q9Y6R4 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
MAP3K4Q9Y6R4 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
MAP3K4Q9Y6R4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
MAP3K4Q9Y6R4 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
MAP3K4Q9Y6R4 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
MAP3K4Q9Y6R4 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
MAP3K4Q9Y6R4 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
MAP3K4Q9Y6R4 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
MAP3K4Q9Y6R4 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
MAP3K4Q9Y6R4 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
MAP3K4Q9Y6R4 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
MAP3K4Q9Y6R4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
MAP3K4Q9Y6R4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
MAP3K4Q9Y6R4 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
MAP3K4Q9Y6R4 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
MAP3K4Q9Y6R4 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
MAP3K4Q9Y6R4 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
MAP3K4Q9Y6R4 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
MAP3K4Q9Y6R4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
MAP3K4Q9Y6R4 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
MAP3K4Q9Y6R4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
MAP3K4Q9Y6R4 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
MAP3K4Q9Y6R4 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
MAP3K4Q9Y6R4 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
MAP3K4Q9Y6R4 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
MAP3K4Q9Y6R4 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
MAP3K4Q9Y6R4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
MAP3K4Q9Y6R4 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
MAP3K4Q9Y6R4 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
MAP3K4Q9Y6R4 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
MAP3K4Q9Y6R4 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
MAP3K4Q9Y6R4 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
MAP3K4Q9Y6R4 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC33.11■■■□□ 2.89
MAP3K4Q9Y6R4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
MAP3K4Q9Y6R4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
MAP3K4Q9Y6R4 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
MAP3K4Q9Y6R4 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
MAP3K4Q9Y6R4 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
MAP3K4Q9Y6R4 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
MAP3K4Q9Y6R4 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC33.1■■■□□ 2.89
MAP3K4Q9Y6R4 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
MAP3K4Q9Y6R4 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
MAP3K4Q9Y6R4 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
MAP3K4Q9Y6R4 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
MAP3K4Q9Y6R4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
MAP3K4Q9Y6R4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
MAP3K4Q9Y6R4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
MAP3K4Q9Y6R4 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
MAP3K4Q9Y6R4 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
MAP3K4Q9Y6R4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
MAP3K4Q9Y6R4 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
MAP3K4Q9Y6R4 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
MAP3K4Q9Y6R4 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC33.09■■■□□ 2.89
MAP3K4Q9Y6R4 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
MAP3K4Q9Y6R4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
MAP3K4Q9Y6R4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
MAP3K4Q9Y6R4 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
MAP3K4Q9Y6R4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
MAP3K4Q9Y6R4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
MAP3K4Q9Y6R4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
MAP3K4Q9Y6R4 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
MAP3K4Q9Y6R4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
MAP3K4Q9Y6R4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
MAP3K4Q9Y6R4 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
MAP3K4Q9Y6R4 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms