Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GTF3C3Q9Y5Q9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GTF3C3Q9Y5Q9 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GTF3C3Q9Y5Q9 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GTF3C3Q9Y5Q9 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GTF3C3Q9Y5Q9 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GTF3C3Q9Y5Q9 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GTF3C3Q9Y5Q9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GTF3C3Q9Y5Q9 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GTF3C3Q9Y5Q9 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GTF3C3Q9Y5Q9 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GTF3C3Q9Y5Q9 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GTF3C3Q9Y5Q9 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GTF3C3Q9Y5Q9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GTF3C3Q9Y5Q9 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GTF3C3Q9Y5Q9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GTF3C3Q9Y5Q9 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GTF3C3Q9Y5Q9 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
GTF3C3Q9Y5Q9 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
GTF3C3Q9Y5Q9 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
GTF3C3Q9Y5Q9 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
GTF3C3Q9Y5Q9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
GTF3C3Q9Y5Q9 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
GTF3C3Q9Y5Q9 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GTF3C3Q9Y5Q9 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
GTF3C3Q9Y5Q9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GTF3C3Q9Y5Q9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GTF3C3Q9Y5Q9 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GTF3C3Q9Y5Q9 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GTF3C3Q9Y5Q9 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GTF3C3Q9Y5Q9 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GTF3C3Q9Y5Q9 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GTF3C3Q9Y5Q9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GTF3C3Q9Y5Q9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GTF3C3Q9Y5Q9 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GTF3C3Q9Y5Q9 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GTF3C3Q9Y5Q9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
GTF3C3Q9Y5Q9 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GTF3C3Q9Y5Q9 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GTF3C3Q9Y5Q9 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GTF3C3Q9Y5Q9 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GTF3C3Q9Y5Q9 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GTF3C3Q9Y5Q9 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GTF3C3Q9Y5Q9 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GTF3C3Q9Y5Q9 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GTF3C3Q9Y5Q9 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GTF3C3Q9Y5Q9 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GTF3C3Q9Y5Q9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GTF3C3Q9Y5Q9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GTF3C3Q9Y5Q9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GTF3C3Q9Y5Q9 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GTF3C3Q9Y5Q9 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GTF3C3Q9Y5Q9 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GTF3C3Q9Y5Q9 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GTF3C3Q9Y5Q9 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GTF3C3Q9Y5Q9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GTF3C3Q9Y5Q9 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GTF3C3Q9Y5Q9 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GTF3C3Q9Y5Q9 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GTF3C3Q9Y5Q9 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GTF3C3Q9Y5Q9 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GTF3C3Q9Y5Q9 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
GTF3C3Q9Y5Q9 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GTF3C3Q9Y5Q9 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GTF3C3Q9Y5Q9 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GTF3C3Q9Y5Q9 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GTF3C3Q9Y5Q9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GTF3C3Q9Y5Q9 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GTF3C3Q9Y5Q9 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GTF3C3Q9Y5Q9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GTF3C3Q9Y5Q9 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GTF3C3Q9Y5Q9 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GTF3C3Q9Y5Q9 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GTF3C3Q9Y5Q9 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GTF3C3Q9Y5Q9 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GTF3C3Q9Y5Q9 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GTF3C3Q9Y5Q9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GTF3C3Q9Y5Q9 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GTF3C3Q9Y5Q9 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GTF3C3Q9Y5Q9 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
GTF3C3Q9Y5Q9 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GTF3C3Q9Y5Q9 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GTF3C3Q9Y5Q9 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GTF3C3Q9Y5Q9 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GTF3C3Q9Y5Q9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GTF3C3Q9Y5Q9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GTF3C3Q9Y5Q9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GTF3C3Q9Y5Q9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
GTF3C3Q9Y5Q9 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GTF3C3Q9Y5Q9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GTF3C3Q9Y5Q9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GTF3C3Q9Y5Q9 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GTF3C3Q9Y5Q9 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
GTF3C3Q9Y5Q9 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GTF3C3Q9Y5Q9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GTF3C3Q9Y5Q9 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 634.8 ms