Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5J5

PHLDA3, Pleckstrin homology-like domain family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDA3Q9Y5J5 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHLDA3Q9Y5J5 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHLDA3Q9Y5J5 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHLDA3Q9Y5J5 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHLDA3Q9Y5J5 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHLDA3Q9Y5J5 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHLDA3Q9Y5J5 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHLDA3Q9Y5J5 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHLDA3Q9Y5J5 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHLDA3Q9Y5J5 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHLDA3Q9Y5J5 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHLDA3Q9Y5J5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHLDA3Q9Y5J5 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PHLDA3Q9Y5J5 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHLDA3Q9Y5J5 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHLDA3Q9Y5J5 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHLDA3Q9Y5J5 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHLDA3Q9Y5J5 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHLDA3Q9Y5J5 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHLDA3Q9Y5J5 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHLDA3Q9Y5J5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHLDA3Q9Y5J5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHLDA3Q9Y5J5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHLDA3Q9Y5J5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHLDA3Q9Y5J5 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms