Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4W6

AFG3L2, AFG3-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L2Q9Y4W6 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AFG3L2Q9Y4W6 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AFG3L2Q9Y4W6 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AFG3L2Q9Y4W6 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AFG3L2Q9Y4W6 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
AFG3L2Q9Y4W6 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AFG3L2Q9Y4W6 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
AFG3L2Q9Y4W6 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
AFG3L2Q9Y4W6 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
AFG3L2Q9Y4W6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AFG3L2Q9Y4W6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AFG3L2Q9Y4W6 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AFG3L2Q9Y4W6 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
AFG3L2Q9Y4W6 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
AFG3L2Q9Y4W6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
AFG3L2Q9Y4W6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AFG3L2Q9Y4W6 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
AFG3L2Q9Y4W6 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
AFG3L2Q9Y4W6 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
AFG3L2Q9Y4W6 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
AFG3L2Q9Y4W6 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
AFG3L2Q9Y4W6 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
AFG3L2Q9Y4W6 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
AFG3L2Q9Y4W6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AFG3L2Q9Y4W6 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
AFG3L2Q9Y4W6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AFG3L2Q9Y4W6 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AFG3L2Q9Y4W6 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AFG3L2Q9Y4W6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AFG3L2Q9Y4W6 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AFG3L2Q9Y4W6 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AFG3L2Q9Y4W6 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
AFG3L2Q9Y4W6 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AFG3L2Q9Y4W6 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
AFG3L2Q9Y4W6 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AFG3L2Q9Y4W6 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
AFG3L2Q9Y4W6 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
AFG3L2Q9Y4W6 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
AFG3L2Q9Y4W6 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AFG3L2Q9Y4W6 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
AFG3L2Q9Y4W6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
AFG3L2Q9Y4W6 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
AFG3L2Q9Y4W6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
AFG3L2Q9Y4W6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
AFG3L2Q9Y4W6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
AFG3L2Q9Y4W6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
AFG3L2Q9Y4W6 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
AFG3L2Q9Y4W6 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
AFG3L2Q9Y4W6 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
AFG3L2Q9Y4W6 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
AFG3L2Q9Y4W6 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
AFG3L2Q9Y4W6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
AFG3L2Q9Y4W6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
AFG3L2Q9Y4W6 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
AFG3L2Q9Y4W6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
AFG3L2Q9Y4W6 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
AFG3L2Q9Y4W6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AFG3L2Q9Y4W6 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
AFG3L2Q9Y4W6 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
AFG3L2Q9Y4W6 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AFG3L2Q9Y4W6 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
AFG3L2Q9Y4W6 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AFG3L2Q9Y4W6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
AFG3L2Q9Y4W6 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AFG3L2Q9Y4W6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
AFG3L2Q9Y4W6 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AFG3L2Q9Y4W6 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
AFG3L2Q9Y4W6 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
AFG3L2Q9Y4W6 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
AFG3L2Q9Y4W6 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
AFG3L2Q9Y4W6 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
AFG3L2Q9Y4W6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
AFG3L2Q9Y4W6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AFG3L2Q9Y4W6 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AFG3L2Q9Y4W6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
AFG3L2Q9Y4W6 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
AFG3L2Q9Y4W6 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
AFG3L2Q9Y4W6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
AFG3L2Q9Y4W6 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
AFG3L2Q9Y4W6 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
AFG3L2Q9Y4W6 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
AFG3L2Q9Y4W6 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
AFG3L2Q9Y4W6 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
AFG3L2Q9Y4W6 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
AFG3L2Q9Y4W6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
AFG3L2Q9Y4W6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
AFG3L2Q9Y4W6 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
AFG3L2Q9Y4W6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
AFG3L2Q9Y4W6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
AFG3L2Q9Y4W6 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AFG3L2Q9Y4W6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
AFG3L2Q9Y4W6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AFG3L2Q9Y4W6 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AFG3L2Q9Y4W6 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
AFG3L2Q9Y4W6 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
AFG3L2Q9Y4W6 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AFG3L2Q9Y4W6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AFG3L2Q9Y4W6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AFG3L2Q9Y4W6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
AFG3L2Q9Y4W6 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms