Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4A5

TRRAP, Transformation/transcription domain-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRRAPQ9Y4A5 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRRAPQ9Y4A5 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRRAPQ9Y4A5 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRRAPQ9Y4A5 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRRAPQ9Y4A5 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRRAPQ9Y4A5 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRRAPQ9Y4A5 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRRAPQ9Y4A5 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRRAPQ9Y4A5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRRAPQ9Y4A5 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRRAPQ9Y4A5 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRRAPQ9Y4A5 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRRAPQ9Y4A5 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRRAPQ9Y4A5 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRRAPQ9Y4A5 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRRAPQ9Y4A5 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRRAPQ9Y4A5 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRRAPQ9Y4A5 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRRAPQ9Y4A5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRRAPQ9Y4A5 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRRAPQ9Y4A5 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRRAPQ9Y4A5 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRRAPQ9Y4A5 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRRAPQ9Y4A5 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRRAPQ9Y4A5 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRRAPQ9Y4A5 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRRAPQ9Y4A5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRRAPQ9Y4A5 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRRAPQ9Y4A5 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRRAPQ9Y4A5 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRRAPQ9Y4A5 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRRAPQ9Y4A5 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRRAPQ9Y4A5 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TRRAPQ9Y4A5 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TRRAPQ9Y4A5 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRRAPQ9Y4A5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRRAPQ9Y4A5 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRRAPQ9Y4A5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRRAPQ9Y4A5 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRRAPQ9Y4A5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRRAPQ9Y4A5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRRAPQ9Y4A5 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TRRAPQ9Y4A5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRRAPQ9Y4A5 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRRAPQ9Y4A5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRRAPQ9Y4A5 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRRAPQ9Y4A5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRRAPQ9Y4A5 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRRAPQ9Y4A5 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRRAPQ9Y4A5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRRAPQ9Y4A5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRRAPQ9Y4A5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRRAPQ9Y4A5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRRAPQ9Y4A5 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRRAPQ9Y4A5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRRAPQ9Y4A5 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRRAPQ9Y4A5 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRRAPQ9Y4A5 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TRRAPQ9Y4A5 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRRAPQ9Y4A5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRRAPQ9Y4A5 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRRAPQ9Y4A5 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRRAPQ9Y4A5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRRAPQ9Y4A5 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TRRAPQ9Y4A5 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRRAPQ9Y4A5 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TRRAPQ9Y4A5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRRAPQ9Y4A5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRRAPQ9Y4A5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRRAPQ9Y4A5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRRAPQ9Y4A5 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRRAPQ9Y4A5 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRRAPQ9Y4A5 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRRAPQ9Y4A5 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRRAPQ9Y4A5 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRRAPQ9Y4A5 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRRAPQ9Y4A5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRRAPQ9Y4A5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRRAPQ9Y4A5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRRAPQ9Y4A5 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRRAPQ9Y4A5 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRRAPQ9Y4A5 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRRAPQ9Y4A5 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRRAPQ9Y4A5 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TRRAPQ9Y4A5 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRRAPQ9Y4A5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRRAPQ9Y4A5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRRAPQ9Y4A5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRRAPQ9Y4A5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRRAPQ9Y4A5 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRRAPQ9Y4A5 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRRAPQ9Y4A5 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRRAPQ9Y4A5 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRRAPQ9Y4A5 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TRRAPQ9Y4A5 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRRAPQ9Y4A5 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRRAPQ9Y4A5 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TRRAPQ9Y4A5 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRRAPQ9Y4A5 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRRAPQ9Y4A5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms