Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y446

PKP3, Plakophilin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3Q9Y446 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PKP3Q9Y446 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PKP3Q9Y446 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PKP3Q9Y446 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PKP3Q9Y446 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PKP3Q9Y446 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PKP3Q9Y446 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PKP3Q9Y446 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PKP3Q9Y446 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PKP3Q9Y446 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PKP3Q9Y446 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PKP3Q9Y446 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PKP3Q9Y446 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PKP3Q9Y446 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PKP3Q9Y446 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PKP3Q9Y446 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PKP3Q9Y446 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PKP3Q9Y446 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PKP3Q9Y446 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PKP3Q9Y446 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PKP3Q9Y446 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PKP3Q9Y446 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PKP3Q9Y446 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PKP3Q9Y446 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PKP3Q9Y446 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PKP3Q9Y446 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PKP3Q9Y446 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PKP3Q9Y446 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PKP3Q9Y446 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PKP3Q9Y446 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PKP3Q9Y446 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PKP3Q9Y446 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PKP3Q9Y446 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PKP3Q9Y446 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PKP3Q9Y446 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PKP3Q9Y446 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PKP3Q9Y446 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PKP3Q9Y446 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PKP3Q9Y446 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PKP3Q9Y446 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PKP3Q9Y446 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PKP3Q9Y446 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PKP3Q9Y446 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PKP3Q9Y446 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PKP3Q9Y446 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PKP3Q9Y446 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PKP3Q9Y446 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PKP3Q9Y446 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PKP3Q9Y446 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PKP3Q9Y446 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PKP3Q9Y446 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PKP3Q9Y446 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PKP3Q9Y446 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PKP3Q9Y446 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PKP3Q9Y446 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PKP3Q9Y446 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PKP3Q9Y446 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PKP3Q9Y446 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PKP3Q9Y446 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PKP3Q9Y446 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PKP3Q9Y446 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PKP3Q9Y446 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PKP3Q9Y446 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PKP3Q9Y446 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PKP3Q9Y446 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PKP3Q9Y446 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PKP3Q9Y446 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PKP3Q9Y446 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PKP3Q9Y446 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PKP3Q9Y446 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PKP3Q9Y446 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PKP3Q9Y446 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PKP3Q9Y446 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PKP3Q9Y446 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PKP3Q9Y446 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PKP3Q9Y446 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PKP3Q9Y446 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PKP3Q9Y446 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PKP3Q9Y446 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PKP3Q9Y446 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PKP3Q9Y446 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PKP3Q9Y446 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PKP3Q9Y446 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PKP3Q9Y446 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PKP3Q9Y446 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PKP3Q9Y446 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PKP3Q9Y446 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PKP3Q9Y446 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PKP3Q9Y446 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PKP3Q9Y446 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PKP3Q9Y446 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PKP3Q9Y446 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PKP3Q9Y446 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PKP3Q9Y446 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PKP3Q9Y446 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PKP3Q9Y446 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PKP3Q9Y446 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PKP3Q9Y446 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKP3Q9Y446 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKP3Q9Y446 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms