Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y343

SNX24, Sorting nexin-24, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX24Q9Y343 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX24Q9Y343 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX24Q9Y343 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX24Q9Y343 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX24Q9Y343 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX24Q9Y343 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX24Q9Y343 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX24Q9Y343 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX24Q9Y343 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX24Q9Y343 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX24Q9Y343 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX24Q9Y343 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX24Q9Y343 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX24Q9Y343 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX24Q9Y343 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNX24Q9Y343 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNX24Q9Y343 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNX24Q9Y343 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNX24Q9Y343 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNX24Q9Y343 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNX24Q9Y343 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX24Q9Y343 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX24Q9Y343 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX24Q9Y343 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX24Q9Y343 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX24Q9Y343 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX24Q9Y343 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX24Q9Y343 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX24Q9Y343 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX24Q9Y343 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX24Q9Y343 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX24Q9Y343 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX24Q9Y343 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX24Q9Y343 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX24Q9Y343 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX24Q9Y343 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX24Q9Y343 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX24Q9Y343 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX24Q9Y343 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX24Q9Y343 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX24Q9Y343 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX24Q9Y343 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX24Q9Y343 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX24Q9Y343 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX24Q9Y343 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX24Q9Y343 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX24Q9Y343 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX24Q9Y343 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX24Q9Y343 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX24Q9Y343 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX24Q9Y343 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX24Q9Y343 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX24Q9Y343 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX24Q9Y343 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX24Q9Y343 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX24Q9Y343 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX24Q9Y343 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX24Q9Y343 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX24Q9Y343 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX24Q9Y343 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX24Q9Y343 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX24Q9Y343 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX24Q9Y343 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX24Q9Y343 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX24Q9Y343 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX24Q9Y343 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX24Q9Y343 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX24Q9Y343 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX24Q9Y343 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX24Q9Y343 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX24Q9Y343 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX24Q9Y343 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX24Q9Y343 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX24Q9Y343 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX24Q9Y343 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX24Q9Y343 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX24Q9Y343 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX24Q9Y343 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX24Q9Y343 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX24Q9Y343 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX24Q9Y343 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX24Q9Y343 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX24Q9Y343 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX24Q9Y343 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX24Q9Y343 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX24Q9Y343 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX24Q9Y343 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX24Q9Y343 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX24Q9Y343 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX24Q9Y343 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX24Q9Y343 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX24Q9Y343 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX24Q9Y343 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX24Q9Y343 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX24Q9Y343 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX24Q9Y343 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX24Q9Y343 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX24Q9Y343 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX24Q9Y343 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX24Q9Y343 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms