Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y235

APOBEC2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC2Q9Y235 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOBEC2Q9Y235 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOBEC2Q9Y235 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOBEC2Q9Y235 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOBEC2Q9Y235 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOBEC2Q9Y235 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
APOBEC2Q9Y235 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOBEC2Q9Y235 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBEC2Q9Y235 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBEC2Q9Y235 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBEC2Q9Y235 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBEC2Q9Y235 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBEC2Q9Y235 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBEC2Q9Y235 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBEC2Q9Y235 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBEC2Q9Y235 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBEC2Q9Y235 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBEC2Q9Y235 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBEC2Q9Y235 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBEC2Q9Y235 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBEC2Q9Y235 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBEC2Q9Y235 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBEC2Q9Y235 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBEC2Q9Y235 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBEC2Q9Y235 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBEC2Q9Y235 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBEC2Q9Y235 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBEC2Q9Y235 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOBEC2Q9Y235 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOBEC2Q9Y235 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOBEC2Q9Y235 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOBEC2Q9Y235 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOBEC2Q9Y235 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOBEC2Q9Y235 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOBEC2Q9Y235 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOBEC2Q9Y235 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOBEC2Q9Y235 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOBEC2Q9Y235 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOBEC2Q9Y235 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOBEC2Q9Y235 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOBEC2Q9Y235 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOBEC2Q9Y235 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOBEC2Q9Y235 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOBEC2Q9Y235 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOBEC2Q9Y235 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOBEC2Q9Y235 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOBEC2Q9Y235 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOBEC2Q9Y235 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOBEC2Q9Y235 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOBEC2Q9Y235 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOBEC2Q9Y235 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOBEC2Q9Y235 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOBEC2Q9Y235 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOBEC2Q9Y235 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOBEC2Q9Y235 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOBEC2Q9Y235 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOBEC2Q9Y235 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOBEC2Q9Y235 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOBEC2Q9Y235 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOBEC2Q9Y235 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOBEC2Q9Y235 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOBEC2Q9Y235 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOBEC2Q9Y235 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOBEC2Q9Y235 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOBEC2Q9Y235 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOBEC2Q9Y235 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOBEC2Q9Y235 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOBEC2Q9Y235 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOBEC2Q9Y235 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOBEC2Q9Y235 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOBEC2Q9Y235 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBEC2Q9Y235 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBEC2Q9Y235 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBEC2Q9Y235 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBEC2Q9Y235 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBEC2Q9Y235 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBEC2Q9Y235 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBEC2Q9Y235 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBEC2Q9Y235 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBEC2Q9Y235 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBEC2Q9Y235 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBEC2Q9Y235 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBEC2Q9Y235 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBEC2Q9Y235 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBEC2Q9Y235 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBEC2Q9Y235 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBEC2Q9Y235 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBEC2Q9Y235 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBEC2Q9Y235 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBEC2Q9Y235 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBEC2Q9Y235 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOBEC2Q9Y235 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOBEC2Q9Y235 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOBEC2Q9Y235 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOBEC2Q9Y235 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOBEC2Q9Y235 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOBEC2Q9Y235 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOBEC2Q9Y235 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOBEC2Q9Y235 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOBEC2Q9Y235 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms