Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y215

COLQ, Acetylcholinesterase collagenic tail peptide, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLQQ9Y215 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COLQQ9Y215 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COLQQ9Y215 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COLQQ9Y215 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COLQQ9Y215 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
COLQQ9Y215 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
COLQQ9Y215 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
COLQQ9Y215 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
COLQQ9Y215 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
COLQQ9Y215 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COLQQ9Y215 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COLQQ9Y215 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COLQQ9Y215 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COLQQ9Y215 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COLQQ9Y215 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COLQQ9Y215 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COLQQ9Y215 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
COLQQ9Y215 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
COLQQ9Y215 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COLQQ9Y215 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COLQQ9Y215 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COLQQ9Y215 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COLQQ9Y215 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COLQQ9Y215 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COLQQ9Y215 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COLQQ9Y215 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COLQQ9Y215 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COLQQ9Y215 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COLQQ9Y215 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COLQQ9Y215 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COLQQ9Y215 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COLQQ9Y215 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COLQQ9Y215 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COLQQ9Y215 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COLQQ9Y215 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COLQQ9Y215 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
COLQQ9Y215 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COLQQ9Y215 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COLQQ9Y215 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
COLQQ9Y215 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COLQQ9Y215 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COLQQ9Y215 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COLQQ9Y215 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COLQQ9Y215 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COLQQ9Y215 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COLQQ9Y215 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COLQQ9Y215 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COLQQ9Y215 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COLQQ9Y215 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COLQQ9Y215 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COLQQ9Y215 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COLQQ9Y215 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
COLQQ9Y215 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COLQQ9Y215 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COLQQ9Y215 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COLQQ9Y215 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COLQQ9Y215 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COLQQ9Y215 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COLQQ9Y215 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COLQQ9Y215 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COLQQ9Y215 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COLQQ9Y215 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COLQQ9Y215 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COLQQ9Y215 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COLQQ9Y215 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COLQQ9Y215 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COLQQ9Y215 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COLQQ9Y215 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COLQQ9Y215 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COLQQ9Y215 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COLQQ9Y215 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COLQQ9Y215 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COLQQ9Y215 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COLQQ9Y215 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COLQQ9Y215 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COLQQ9Y215 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COLQQ9Y215 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COLQQ9Y215 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COLQQ9Y215 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COLQQ9Y215 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
COLQQ9Y215 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COLQQ9Y215 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COLQQ9Y215 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COLQQ9Y215 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COLQQ9Y215 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COLQQ9Y215 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COLQQ9Y215 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
COLQQ9Y215 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
COLQQ9Y215 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COLQQ9Y215 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COLQQ9Y215 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COLQQ9Y215 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COLQQ9Y215 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COLQQ9Y215 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COLQQ9Y215 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
COLQQ9Y215 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COLQQ9Y215 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COLQQ9Y215 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COLQQ9Y215 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COLQQ9Y215 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms