Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQB3

CTNND2, Catenin delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNND2Q9UQB3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTNND2Q9UQB3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTNND2Q9UQB3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTNND2Q9UQB3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTNND2Q9UQB3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTNND2Q9UQB3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTNND2Q9UQB3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTNND2Q9UQB3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTNND2Q9UQB3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTNND2Q9UQB3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTNND2Q9UQB3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTNND2Q9UQB3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTNND2Q9UQB3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTNND2Q9UQB3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTNND2Q9UQB3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTNND2Q9UQB3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTNND2Q9UQB3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTNND2Q9UQB3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTNND2Q9UQB3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTNND2Q9UQB3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTNND2Q9UQB3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTNND2Q9UQB3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTNND2Q9UQB3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTNND2Q9UQB3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CTNND2Q9UQB3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CTNND2Q9UQB3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CTNND2Q9UQB3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CTNND2Q9UQB3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CTNND2Q9UQB3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTNND2Q9UQB3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTNND2Q9UQB3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTNND2Q9UQB3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTNND2Q9UQB3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTNND2Q9UQB3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CTNND2Q9UQB3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTNND2Q9UQB3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTNND2Q9UQB3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTNND2Q9UQB3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTNND2Q9UQB3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTNND2Q9UQB3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTNND2Q9UQB3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTNND2Q9UQB3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTNND2Q9UQB3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTNND2Q9UQB3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTNND2Q9UQB3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTNND2Q9UQB3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTNND2Q9UQB3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTNND2Q9UQB3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTNND2Q9UQB3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTNND2Q9UQB3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTNND2Q9UQB3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTNND2Q9UQB3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTNND2Q9UQB3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTNND2Q9UQB3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTNND2Q9UQB3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTNND2Q9UQB3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTNND2Q9UQB3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTNND2Q9UQB3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTNND2Q9UQB3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTNND2Q9UQB3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTNND2Q9UQB3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTNND2Q9UQB3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTNND2Q9UQB3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTNND2Q9UQB3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CTNND2Q9UQB3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTNND2Q9UQB3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTNND2Q9UQB3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTNND2Q9UQB3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTNND2Q9UQB3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTNND2Q9UQB3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTNND2Q9UQB3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CTNND2Q9UQB3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTNND2Q9UQB3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTNND2Q9UQB3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTNND2Q9UQB3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTNND2Q9UQB3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTNND2Q9UQB3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTNND2Q9UQB3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTNND2Q9UQB3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTNND2Q9UQB3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTNND2Q9UQB3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CTNND2Q9UQB3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTNND2Q9UQB3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTNND2Q9UQB3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTNND2Q9UQB3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTNND2Q9UQB3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTNND2Q9UQB3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTNND2Q9UQB3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTNND2Q9UQB3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTNND2Q9UQB3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTNND2Q9UQB3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTNND2Q9UQB3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTNND2Q9UQB3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTNND2Q9UQB3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTNND2Q9UQB3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTNND2Q9UQB3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTNND2Q9UQB3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CTNND2Q9UQB3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CTNND2Q9UQB3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CTNND2Q9UQB3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms