Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
TRAK1Q9UPV9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
TRAK1Q9UPV9 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
TRAK1Q9UPV9 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
TRAK1Q9UPV9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
TRAK1Q9UPV9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TRAK1Q9UPV9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TRAK1Q9UPV9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TRAK1Q9UPV9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TRAK1Q9UPV9 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TRAK1Q9UPV9 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TRAK1Q9UPV9 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TRAK1Q9UPV9 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
TRAK1Q9UPV9 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TRAK1Q9UPV9 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TRAK1Q9UPV9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
TRAK1Q9UPV9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TRAK1Q9UPV9 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TRAK1Q9UPV9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TRAK1Q9UPV9 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TRAK1Q9UPV9 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TRAK1Q9UPV9 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TRAK1Q9UPV9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TRAK1Q9UPV9 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TRAK1Q9UPV9 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TRAK1Q9UPV9 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TRAK1Q9UPV9 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TRAK1Q9UPV9 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TRAK1Q9UPV9 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
TRAK1Q9UPV9 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
TRAK1Q9UPV9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TRAK1Q9UPV9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TRAK1Q9UPV9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TRAK1Q9UPV9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TRAK1Q9UPV9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TRAK1Q9UPV9 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TRAK1Q9UPV9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
TRAK1Q9UPV9 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
TRAK1Q9UPV9 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TRAK1Q9UPV9 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC30.09■■■□□ 2.41
TRAK1Q9UPV9 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TRAK1Q9UPV9 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
TRAK1Q9UPV9 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
TRAK1Q9UPV9 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TRAK1Q9UPV9 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TRAK1Q9UPV9 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TRAK1Q9UPV9 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TRAK1Q9UPV9 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TRAK1Q9UPV9 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TRAK1Q9UPV9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TRAK1Q9UPV9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TRAK1Q9UPV9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TRAK1Q9UPV9 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TRAK1Q9UPV9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TRAK1Q9UPV9 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TRAK1Q9UPV9 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TRAK1Q9UPV9 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TRAK1Q9UPV9 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TRAK1Q9UPV9 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TRAK1Q9UPV9 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TRAK1Q9UPV9 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TRAK1Q9UPV9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TRAK1Q9UPV9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TRAK1Q9UPV9 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TRAK1Q9UPV9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TRAK1Q9UPV9 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TRAK1Q9UPV9 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TRAK1Q9UPV9 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TRAK1Q9UPV9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TRAK1Q9UPV9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TRAK1Q9UPV9 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TRAK1Q9UPV9 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TRAK1Q9UPV9 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TRAK1Q9UPV9 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TRAK1Q9UPV9 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TRAK1Q9UPV9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TRAK1Q9UPV9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TRAK1Q9UPV9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
TRAK1Q9UPV9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TRAK1Q9UPV9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TRAK1Q9UPV9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TRAK1Q9UPV9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TRAK1Q9UPV9 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TRAK1Q9UPV9 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TRAK1Q9UPV9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TRAK1Q9UPV9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TRAK1Q9UPV9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TRAK1Q9UPV9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TRAK1Q9UPV9 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TRAK1Q9UPV9 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TRAK1Q9UPV9 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TRAK1Q9UPV9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TRAK1Q9UPV9 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TRAK1Q9UPV9 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TRAK1Q9UPV9 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TRAK1Q9UPV9 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TRAK1Q9UPV9 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TRAK1Q9UPV9 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TRAK1Q9UPV9 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TRAK1Q9UPV9 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms