Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ7

PDZRN3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN3Q9UPQ7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PDZRN3Q9UPQ7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PDZRN3Q9UPQ7 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PDZRN3Q9UPQ7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PDZRN3Q9UPQ7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PDZRN3Q9UPQ7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PDZRN3Q9UPQ7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PDZRN3Q9UPQ7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PDZRN3Q9UPQ7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PDZRN3Q9UPQ7 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PDZRN3Q9UPQ7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PDZRN3Q9UPQ7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PDZRN3Q9UPQ7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDZRN3Q9UPQ7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDZRN3Q9UPQ7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PDZRN3Q9UPQ7 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDZRN3Q9UPQ7 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PDZRN3Q9UPQ7 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDZRN3Q9UPQ7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDZRN3Q9UPQ7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDZRN3Q9UPQ7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDZRN3Q9UPQ7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDZRN3Q9UPQ7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDZRN3Q9UPQ7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDZRN3Q9UPQ7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDZRN3Q9UPQ7 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDZRN3Q9UPQ7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDZRN3Q9UPQ7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDZRN3Q9UPQ7 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDZRN3Q9UPQ7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDZRN3Q9UPQ7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDZRN3Q9UPQ7 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDZRN3Q9UPQ7 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PDZRN3Q9UPQ7 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDZRN3Q9UPQ7 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDZRN3Q9UPQ7 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PDZRN3Q9UPQ7 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDZRN3Q9UPQ7 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDZRN3Q9UPQ7 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDZRN3Q9UPQ7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDZRN3Q9UPQ7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDZRN3Q9UPQ7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDZRN3Q9UPQ7 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PDZRN3Q9UPQ7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDZRN3Q9UPQ7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDZRN3Q9UPQ7 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDZRN3Q9UPQ7 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDZRN3Q9UPQ7 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDZRN3Q9UPQ7 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDZRN3Q9UPQ7 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDZRN3Q9UPQ7 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PDZRN3Q9UPQ7 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDZRN3Q9UPQ7 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDZRN3Q9UPQ7 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PDZRN3Q9UPQ7 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDZRN3Q9UPQ7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDZRN3Q9UPQ7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDZRN3Q9UPQ7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDZRN3Q9UPQ7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDZRN3Q9UPQ7 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDZRN3Q9UPQ7 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDZRN3Q9UPQ7 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDZRN3Q9UPQ7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDZRN3Q9UPQ7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDZRN3Q9UPQ7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDZRN3Q9UPQ7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDZRN3Q9UPQ7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDZRN3Q9UPQ7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDZRN3Q9UPQ7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDZRN3Q9UPQ7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDZRN3Q9UPQ7 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDZRN3Q9UPQ7 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDZRN3Q9UPQ7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDZRN3Q9UPQ7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDZRN3Q9UPQ7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDZRN3Q9UPQ7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDZRN3Q9UPQ7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDZRN3Q9UPQ7 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDZRN3Q9UPQ7 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDZRN3Q9UPQ7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDZRN3Q9UPQ7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDZRN3Q9UPQ7 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDZRN3Q9UPQ7 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDZRN3Q9UPQ7 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDZRN3Q9UPQ7 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDZRN3Q9UPQ7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
PDZRN3Q9UPQ7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PDZRN3Q9UPQ7 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PDZRN3Q9UPQ7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PDZRN3Q9UPQ7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PDZRN3Q9UPQ7 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PDZRN3Q9UPQ7 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PDZRN3Q9UPQ7 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PDZRN3Q9UPQ7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms