Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPM8

AP4E1, AP-4 complex subunit epsilon-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP4E1Q9UPM8 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP4E1Q9UPM8 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP4E1Q9UPM8 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP4E1Q9UPM8 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP4E1Q9UPM8 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP4E1Q9UPM8 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP4E1Q9UPM8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP4E1Q9UPM8 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP4E1Q9UPM8 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP4E1Q9UPM8 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP4E1Q9UPM8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP4E1Q9UPM8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP4E1Q9UPM8 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP4E1Q9UPM8 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP4E1Q9UPM8 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
AP4E1Q9UPM8 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP4E1Q9UPM8 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP4E1Q9UPM8 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP4E1Q9UPM8 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP4E1Q9UPM8 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP4E1Q9UPM8 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP4E1Q9UPM8 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP4E1Q9UPM8 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP4E1Q9UPM8 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP4E1Q9UPM8 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP4E1Q9UPM8 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP4E1Q9UPM8 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP4E1Q9UPM8 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP4E1Q9UPM8 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP4E1Q9UPM8 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP4E1Q9UPM8 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP4E1Q9UPM8 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP4E1Q9UPM8 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP4E1Q9UPM8 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP4E1Q9UPM8 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP4E1Q9UPM8 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP4E1Q9UPM8 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP4E1Q9UPM8 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP4E1Q9UPM8 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP4E1Q9UPM8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP4E1Q9UPM8 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP4E1Q9UPM8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP4E1Q9UPM8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP4E1Q9UPM8 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP4E1Q9UPM8 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP4E1Q9UPM8 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
AP4E1Q9UPM8 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP4E1Q9UPM8 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
AP4E1Q9UPM8 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP4E1Q9UPM8 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP4E1Q9UPM8 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
AP4E1Q9UPM8 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP4E1Q9UPM8 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP4E1Q9UPM8 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP4E1Q9UPM8 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP4E1Q9UPM8 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP4E1Q9UPM8 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP4E1Q9UPM8 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
AP4E1Q9UPM8 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP4E1Q9UPM8 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP4E1Q9UPM8 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP4E1Q9UPM8 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP4E1Q9UPM8 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP4E1Q9UPM8 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP4E1Q9UPM8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP4E1Q9UPM8 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP4E1Q9UPM8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP4E1Q9UPM8 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP4E1Q9UPM8 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP4E1Q9UPM8 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP4E1Q9UPM8 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP4E1Q9UPM8 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP4E1Q9UPM8 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
AP4E1Q9UPM8 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP4E1Q9UPM8 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP4E1Q9UPM8 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP4E1Q9UPM8 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP4E1Q9UPM8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP4E1Q9UPM8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP4E1Q9UPM8 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AP4E1Q9UPM8 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AP4E1Q9UPM8 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AP4E1Q9UPM8 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AP4E1Q9UPM8 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AP4E1Q9UPM8 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AP4E1Q9UPM8 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AP4E1Q9UPM8 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AP4E1Q9UPM8 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AP4E1Q9UPM8 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
AP4E1Q9UPM8 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AP4E1Q9UPM8 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AP4E1Q9UPM8 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AP4E1Q9UPM8 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
AP4E1Q9UPM8 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AP4E1Q9UPM8 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AP4E1Q9UPM8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP4E1Q9UPM8 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
AP4E1Q9UPM8 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP4E1Q9UPM8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP4E1Q9UPM8 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms