Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ2

SYNRG, Synergin gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNRGQ9UMZ2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYNRGQ9UMZ2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYNRGQ9UMZ2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SYNRGQ9UMZ2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYNRGQ9UMZ2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYNRGQ9UMZ2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYNRGQ9UMZ2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYNRGQ9UMZ2 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYNRGQ9UMZ2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYNRGQ9UMZ2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYNRGQ9UMZ2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYNRGQ9UMZ2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYNRGQ9UMZ2 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYNRGQ9UMZ2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYNRGQ9UMZ2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYNRGQ9UMZ2 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYNRGQ9UMZ2 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYNRGQ9UMZ2 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYNRGQ9UMZ2 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYNRGQ9UMZ2 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYNRGQ9UMZ2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYNRGQ9UMZ2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYNRGQ9UMZ2 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYNRGQ9UMZ2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYNRGQ9UMZ2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYNRGQ9UMZ2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYNRGQ9UMZ2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYNRGQ9UMZ2 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYNRGQ9UMZ2 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SYNRGQ9UMZ2 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYNRGQ9UMZ2 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SYNRGQ9UMZ2 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYNRGQ9UMZ2 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYNRGQ9UMZ2 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYNRGQ9UMZ2 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SYNRGQ9UMZ2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SYNRGQ9UMZ2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYNRGQ9UMZ2 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYNRGQ9UMZ2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYNRGQ9UMZ2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYNRGQ9UMZ2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYNRGQ9UMZ2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYNRGQ9UMZ2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYNRGQ9UMZ2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYNRGQ9UMZ2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYNRGQ9UMZ2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYNRGQ9UMZ2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYNRGQ9UMZ2 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYNRGQ9UMZ2 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYNRGQ9UMZ2 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYNRGQ9UMZ2 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYNRGQ9UMZ2 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYNRGQ9UMZ2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYNRGQ9UMZ2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYNRGQ9UMZ2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYNRGQ9UMZ2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYNRGQ9UMZ2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYNRGQ9UMZ2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYNRGQ9UMZ2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYNRGQ9UMZ2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYNRGQ9UMZ2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYNRGQ9UMZ2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYNRGQ9UMZ2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYNRGQ9UMZ2 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYNRGQ9UMZ2 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYNRGQ9UMZ2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYNRGQ9UMZ2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYNRGQ9UMZ2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYNRGQ9UMZ2 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYNRGQ9UMZ2 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYNRGQ9UMZ2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYNRGQ9UMZ2 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYNRGQ9UMZ2 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYNRGQ9UMZ2 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYNRGQ9UMZ2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYNRGQ9UMZ2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYNRGQ9UMZ2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SYNRGQ9UMZ2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SYNRGQ9UMZ2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SYNRGQ9UMZ2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SYNRGQ9UMZ2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SYNRGQ9UMZ2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SYNRGQ9UMZ2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYNRGQ9UMZ2 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYNRGQ9UMZ2 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SYNRGQ9UMZ2 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYNRGQ9UMZ2 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYNRGQ9UMZ2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYNRGQ9UMZ2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYNRGQ9UMZ2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYNRGQ9UMZ2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYNRGQ9UMZ2 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYNRGQ9UMZ2 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYNRGQ9UMZ2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SYNRGQ9UMZ2 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYNRGQ9UMZ2 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SYNRGQ9UMZ2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYNRGQ9UMZ2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYNRGQ9UMZ2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYNRGQ9UMZ2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms