Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB4

CDH9, Cadherin-9, humanhuman

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH9Q9ULB4 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDH9Q9ULB4 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDH9Q9ULB4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDH9Q9ULB4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDH9Q9ULB4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDH9Q9ULB4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDH9Q9ULB4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDH9Q9ULB4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH9Q9ULB4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH9Q9ULB4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH9Q9ULB4 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH9Q9ULB4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH9Q9ULB4 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH9Q9ULB4 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH9Q9ULB4 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH9Q9ULB4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH9Q9ULB4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH9Q9ULB4 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH9Q9ULB4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH9Q9ULB4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH9Q9ULB4 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH9Q9ULB4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH9Q9ULB4 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH9Q9ULB4 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH9Q9ULB4 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH9Q9ULB4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH9Q9ULB4 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH9Q9ULB4 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH9Q9ULB4 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH9Q9ULB4 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH9Q9ULB4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH9Q9ULB4 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH9Q9ULB4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH9Q9ULB4 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH9Q9ULB4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH9Q9ULB4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH9Q9ULB4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH9Q9ULB4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH9Q9ULB4 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH9Q9ULB4 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH9Q9ULB4 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH9Q9ULB4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH9Q9ULB4 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH9Q9ULB4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH9Q9ULB4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH9Q9ULB4 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH9Q9ULB4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH9Q9ULB4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH9Q9ULB4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH9Q9ULB4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH9Q9ULB4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH9Q9ULB4 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH9Q9ULB4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH9Q9ULB4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH9Q9ULB4 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH9Q9ULB4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH9Q9ULB4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH9Q9ULB4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH9Q9ULB4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH9Q9ULB4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH9Q9ULB4 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH9Q9ULB4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH9Q9ULB4 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH9Q9ULB4 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH9Q9ULB4 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH9Q9ULB4 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH9Q9ULB4 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH9Q9ULB4 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH9Q9ULB4 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH9Q9ULB4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH9Q9ULB4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH9Q9ULB4 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDH9Q9ULB4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDH9Q9ULB4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH9Q9ULB4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH9Q9ULB4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH9Q9ULB4 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH9Q9ULB4 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH9Q9ULB4 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH9Q9ULB4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH9Q9ULB4 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH9Q9ULB4 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH9Q9ULB4 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH9Q9ULB4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH9Q9ULB4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH9Q9ULB4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH9Q9ULB4 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH9Q9ULB4 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH9Q9ULB4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH9Q9ULB4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH9Q9ULB4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH9Q9ULB4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH9Q9ULB4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH9Q9ULB4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH9Q9ULB4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH9Q9ULB4 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH9Q9ULB4 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH9Q9ULB4 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH9Q9ULB4 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH9Q9ULB4 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms