Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAPPC2LQ9UL33 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAPPC2LQ9UL33 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAPPC2LQ9UL33 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAPPC2LQ9UL33 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAPPC2LQ9UL33 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.46
TRAPPC2LQ9UL33 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
TRAPPC2LQ9UL33 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAPPC2LQ9UL33 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAPPC2LQ9UL33 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAPPC2LQ9UL33 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAPPC2LQ9UL33 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAPPC2LQ9UL33 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAPPC2LQ9UL33 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAPPC2LQ9UL33 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAPPC2LQ9UL33 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAPPC2LQ9UL33 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAPPC2LQ9UL33 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAPPC2LQ9UL33 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAPPC2LQ9UL33 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAPPC2LQ9UL33 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAPPC2LQ9UL33 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAPPC2LQ9UL33 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAPPC2LQ9UL33 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAPPC2LQ9UL33 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAPPC2LQ9UL33 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAPPC2LQ9UL33 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAPPC2LQ9UL33 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAPPC2LQ9UL33 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAPPC2LQ9UL33 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAPPC2LQ9UL33 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAPPC2LQ9UL33 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAPPC2LQ9UL33 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAPPC2LQ9UL33 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAPPC2LQ9UL33 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAPPC2LQ9UL33 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC2LQ9UL33 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC2LQ9UL33 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC2LQ9UL33 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC2LQ9UL33 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC2LQ9UL33 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC2LQ9UL33 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC2LQ9UL33 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC2LQ9UL33 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC2LQ9UL33 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC2LQ9UL33 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC2LQ9UL33 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC2LQ9UL33 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC2LQ9UL33 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC2LQ9UL33 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC2LQ9UL33 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC2LQ9UL33 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC2LQ9UL33 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC2LQ9UL33 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC2LQ9UL33 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC2LQ9UL33 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC2LQ9UL33 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC2LQ9UL33 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC2LQ9UL33 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC2LQ9UL33 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC2LQ9UL33 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC2LQ9UL33 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC2LQ9UL33 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC2LQ9UL33 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC2LQ9UL33 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC2LQ9UL33 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC2LQ9UL33 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC2LQ9UL33 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC2LQ9UL33 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC2LQ9UL33 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC2LQ9UL33 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC2LQ9UL33 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC2LQ9UL33 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC2LQ9UL33 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC2LQ9UL33 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC2LQ9UL33 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC2LQ9UL33 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC2LQ9UL33 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC2LQ9UL33 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC2LQ9UL33 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC2LQ9UL33 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC2LQ9UL33 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC2LQ9UL33 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC2LQ9UL33 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC2LQ9UL33 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC2LQ9UL33 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC2LQ9UL33 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC2LQ9UL33 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC2LQ9UL33 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC2LQ9UL33 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC2LQ9UL33 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC2LQ9UL33 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC2LQ9UL33 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC2LQ9UL33 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC2LQ9UL33 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC2LQ9UL33 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms