Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL4

GJD2, Gap junction delta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD2Q9UKL4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GJD2Q9UKL4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GJD2Q9UKL4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GJD2Q9UKL4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GJD2Q9UKL4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJD2Q9UKL4 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJD2Q9UKL4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJD2Q9UKL4 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJD2Q9UKL4 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJD2Q9UKL4 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJD2Q9UKL4 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJD2Q9UKL4 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJD2Q9UKL4 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJD2Q9UKL4 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJD2Q9UKL4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJD2Q9UKL4 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJD2Q9UKL4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GJD2Q9UKL4 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GJD2Q9UKL4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GJD2Q9UKL4 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GJD2Q9UKL4 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GJD2Q9UKL4 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GJD2Q9UKL4 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GJD2Q9UKL4 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GJD2Q9UKL4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GJD2Q9UKL4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GJD2Q9UKL4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GJD2Q9UKL4 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GJD2Q9UKL4 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GJD2Q9UKL4 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GJD2Q9UKL4 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GJD2Q9UKL4 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GJD2Q9UKL4 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GJD2Q9UKL4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GJD2Q9UKL4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GJD2Q9UKL4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GJD2Q9UKL4 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJD2Q9UKL4 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJD2Q9UKL4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJD2Q9UKL4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJD2Q9UKL4 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJD2Q9UKL4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJD2Q9UKL4 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJD2Q9UKL4 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJD2Q9UKL4 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJD2Q9UKL4 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJD2Q9UKL4 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJD2Q9UKL4 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJD2Q9UKL4 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJD2Q9UKL4 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJD2Q9UKL4 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJD2Q9UKL4 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GJD2Q9UKL4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJD2Q9UKL4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJD2Q9UKL4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJD2Q9UKL4 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJD2Q9UKL4 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GJD2Q9UKL4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GJD2Q9UKL4 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GJD2Q9UKL4 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GJD2Q9UKL4 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GJD2Q9UKL4 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GJD2Q9UKL4 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GJD2Q9UKL4 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GJD2Q9UKL4 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GJD2Q9UKL4 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GJD2Q9UKL4 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GJD2Q9UKL4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GJD2Q9UKL4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
GJD2Q9UKL4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GJD2Q9UKL4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GJD2Q9UKL4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GJD2Q9UKL4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
GJD2Q9UKL4 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GJD2Q9UKL4 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
GJD2Q9UKL4 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GJD2Q9UKL4 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GJD2Q9UKL4 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GJD2Q9UKL4 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GJD2Q9UKL4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GJD2Q9UKL4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GJD2Q9UKL4 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GJD2Q9UKL4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GJD2Q9UKL4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJD2Q9UKL4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJD2Q9UKL4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJD2Q9UKL4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJD2Q9UKL4 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJD2Q9UKL4 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJD2Q9UKL4 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJD2Q9UKL4 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJD2Q9UKL4 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJD2Q9UKL4 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GJD2Q9UKL4 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJD2Q9UKL4 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJD2Q9UKL4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJD2Q9UKL4 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GJD2Q9UKL4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GJD2Q9UKL4 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GJD2Q9UKL4 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms