Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY4

GGA2, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA2, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA2Q9UJY4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GGA2Q9UJY4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GGA2Q9UJY4 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GGA2Q9UJY4 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GGA2Q9UJY4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GGA2Q9UJY4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GGA2Q9UJY4 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GGA2Q9UJY4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GGA2Q9UJY4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GGA2Q9UJY4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GGA2Q9UJY4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GGA2Q9UJY4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GGA2Q9UJY4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GGA2Q9UJY4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GGA2Q9UJY4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GGA2Q9UJY4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GGA2Q9UJY4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GGA2Q9UJY4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GGA2Q9UJY4 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GGA2Q9UJY4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GGA2Q9UJY4 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GGA2Q9UJY4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GGA2Q9UJY4 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GGA2Q9UJY4 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GGA2Q9UJY4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GGA2Q9UJY4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GGA2Q9UJY4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GGA2Q9UJY4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GGA2Q9UJY4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GGA2Q9UJY4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GGA2Q9UJY4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GGA2Q9UJY4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GGA2Q9UJY4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GGA2Q9UJY4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GGA2Q9UJY4 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GGA2Q9UJY4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GGA2Q9UJY4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GGA2Q9UJY4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GGA2Q9UJY4 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GGA2Q9UJY4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GGA2Q9UJY4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GGA2Q9UJY4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GGA2Q9UJY4 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GGA2Q9UJY4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GGA2Q9UJY4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GGA2Q9UJY4 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GGA2Q9UJY4 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GGA2Q9UJY4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GGA2Q9UJY4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GGA2Q9UJY4 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GGA2Q9UJY4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GGA2Q9UJY4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GGA2Q9UJY4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GGA2Q9UJY4 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GGA2Q9UJY4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GGA2Q9UJY4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GGA2Q9UJY4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GGA2Q9UJY4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GGA2Q9UJY4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GGA2Q9UJY4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GGA2Q9UJY4 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GGA2Q9UJY4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GGA2Q9UJY4 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GGA2Q9UJY4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GGA2Q9UJY4 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GGA2Q9UJY4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GGA2Q9UJY4 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GGA2Q9UJY4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GGA2Q9UJY4 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GGA2Q9UJY4 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GGA2Q9UJY4 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GGA2Q9UJY4 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GGA2Q9UJY4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GGA2Q9UJY4 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GGA2Q9UJY4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GGA2Q9UJY4 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GGA2Q9UJY4 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GGA2Q9UJY4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GGA2Q9UJY4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GGA2Q9UJY4 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GGA2Q9UJY4 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GGA2Q9UJY4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GGA2Q9UJY4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GGA2Q9UJY4 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GGA2Q9UJY4 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GGA2Q9UJY4 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GGA2Q9UJY4 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GGA2Q9UJY4 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GGA2Q9UJY4 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GGA2Q9UJY4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GGA2Q9UJY4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GGA2Q9UJY4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GGA2Q9UJY4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GGA2Q9UJY4 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GGA2Q9UJY4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GGA2Q9UJY4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GGA2Q9UJY4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GGA2Q9UJY4 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GGA2Q9UJY4 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GGA2Q9UJY4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms