Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJX2

CDC23, Cell division cycle protein 23 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC23Q9UJX2 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC23Q9UJX2 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC23Q9UJX2 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC23Q9UJX2 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC23Q9UJX2 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC23Q9UJX2 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC23Q9UJX2 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC23Q9UJX2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC23Q9UJX2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC23Q9UJX2 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC23Q9UJX2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC23Q9UJX2 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC23Q9UJX2 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC23Q9UJX2 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC23Q9UJX2 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC23Q9UJX2 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC23Q9UJX2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC23Q9UJX2 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC23Q9UJX2 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC23Q9UJX2 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC23Q9UJX2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC23Q9UJX2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC23Q9UJX2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC23Q9UJX2 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC23Q9UJX2 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC23Q9UJX2 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC23Q9UJX2 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC23Q9UJX2 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC23Q9UJX2 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC23Q9UJX2 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC23Q9UJX2 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC23Q9UJX2 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC23Q9UJX2 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC23Q9UJX2 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC23Q9UJX2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC23Q9UJX2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC23Q9UJX2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC23Q9UJX2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC23Q9UJX2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC23Q9UJX2 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC23Q9UJX2 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC23Q9UJX2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC23Q9UJX2 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDC23Q9UJX2 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDC23Q9UJX2 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDC23Q9UJX2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDC23Q9UJX2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDC23Q9UJX2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDC23Q9UJX2 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDC23Q9UJX2 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDC23Q9UJX2 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDC23Q9UJX2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDC23Q9UJX2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDC23Q9UJX2 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDC23Q9UJX2 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDC23Q9UJX2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDC23Q9UJX2 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDC23Q9UJX2 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDC23Q9UJX2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDC23Q9UJX2 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDC23Q9UJX2 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDC23Q9UJX2 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDC23Q9UJX2 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDC23Q9UJX2 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDC23Q9UJX2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDC23Q9UJX2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDC23Q9UJX2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDC23Q9UJX2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CDC23Q9UJX2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDC23Q9UJX2 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDC23Q9UJX2 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDC23Q9UJX2 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDC23Q9UJX2 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDC23Q9UJX2 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDC23Q9UJX2 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDC23Q9UJX2 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDC23Q9UJX2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDC23Q9UJX2 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDC23Q9UJX2 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDC23Q9UJX2 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDC23Q9UJX2 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDC23Q9UJX2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDC23Q9UJX2 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDC23Q9UJX2 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CDC23Q9UJX2 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDC23Q9UJX2 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDC23Q9UJX2 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDC23Q9UJX2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDC23Q9UJX2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDC23Q9UJX2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDC23Q9UJX2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDC23Q9UJX2 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CDC23Q9UJX2 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDC23Q9UJX2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDC23Q9UJX2 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDC23Q9UJX2 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDC23Q9UJX2 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDC23Q9UJX2 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDC23Q9UJX2 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDC23Q9UJX2 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms