Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI40

SLC24A2, Sodium/potassium/calcium exchanger 2, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC24A2Q9UI40 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC24A2Q9UI40 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC24A2Q9UI40 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC24A2Q9UI40 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC24A2Q9UI40 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC24A2Q9UI40 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC24A2Q9UI40 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC24A2Q9UI40 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC24A2Q9UI40 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC24A2Q9UI40 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC24A2Q9UI40 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC24A2Q9UI40 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC24A2Q9UI40 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC24A2Q9UI40 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC24A2Q9UI40 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC24A2Q9UI40 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SLC24A2Q9UI40 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SLC24A2Q9UI40 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SLC24A2Q9UI40 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SLC24A2Q9UI40 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC24A2Q9UI40 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC24A2Q9UI40 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC24A2Q9UI40 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC24A2Q9UI40 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC24A2Q9UI40 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC24A2Q9UI40 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC24A2Q9UI40 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC24A2Q9UI40 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC24A2Q9UI40 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC24A2Q9UI40 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC24A2Q9UI40 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC24A2Q9UI40 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC24A2Q9UI40 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC24A2Q9UI40 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC24A2Q9UI40 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC24A2Q9UI40 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC24A2Q9UI40 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC24A2Q9UI40 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC24A2Q9UI40 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC24A2Q9UI40 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC24A2Q9UI40 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC24A2Q9UI40 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC24A2Q9UI40 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC24A2Q9UI40 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC24A2Q9UI40 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC24A2Q9UI40 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC24A2Q9UI40 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC24A2Q9UI40 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC24A2Q9UI40 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC24A2Q9UI40 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC24A2Q9UI40 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC24A2Q9UI40 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC24A2Q9UI40 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC24A2Q9UI40 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC24A2Q9UI40 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC24A2Q9UI40 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC24A2Q9UI40 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC24A2Q9UI40 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC24A2Q9UI40 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC24A2Q9UI40 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC24A2Q9UI40 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC24A2Q9UI40 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC24A2Q9UI40 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC24A2Q9UI40 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC24A2Q9UI40 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC24A2Q9UI40 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC24A2Q9UI40 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC24A2Q9UI40 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC24A2Q9UI40 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC24A2Q9UI40 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC24A2Q9UI40 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC24A2Q9UI40 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC24A2Q9UI40 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC24A2Q9UI40 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC24A2Q9UI40 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC24A2Q9UI40 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC24A2Q9UI40 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC24A2Q9UI40 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC24A2Q9UI40 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC24A2Q9UI40 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC24A2Q9UI40 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC24A2Q9UI40 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC24A2Q9UI40 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC24A2Q9UI40 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC24A2Q9UI40 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC24A2Q9UI40 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC24A2Q9UI40 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC24A2Q9UI40 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC24A2Q9UI40 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC24A2Q9UI40 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC24A2Q9UI40 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC24A2Q9UI40 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC24A2Q9UI40 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC24A2Q9UI40 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC24A2Q9UI40 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC24A2Q9UI40 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC24A2Q9UI40 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC24A2Q9UI40 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC24A2Q9UI40 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC24A2Q9UI40 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms