Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
KDM5BQ9UGL1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
KDM5BQ9UGL1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
KDM5BQ9UGL1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
KDM5BQ9UGL1 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
KDM5BQ9UGL1 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
KDM5BQ9UGL1 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC33.78■■■■□ 3
KDM5BQ9UGL1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
KDM5BQ9UGL1 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
KDM5BQ9UGL1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
KDM5BQ9UGL1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
KDM5BQ9UGL1 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
KDM5BQ9UGL1 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
KDM5BQ9UGL1 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC33.76■■■■□ 3
KDM5BQ9UGL1 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC33.76■■■■□ 3
KDM5BQ9UGL1 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
KDM5BQ9UGL1 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
KDM5BQ9UGL1 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC33.76■■■■□ 3
KDM5BQ9UGL1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
KDM5BQ9UGL1 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
KDM5BQ9UGL1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
KDM5BQ9UGL1 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
KDM5BQ9UGL1 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
KDM5BQ9UGL1 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
KDM5BQ9UGL1 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
KDM5BQ9UGL1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
KDM5BQ9UGL1 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
KDM5BQ9UGL1 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
KDM5BQ9UGL1 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
KDM5BQ9UGL1 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
KDM5BQ9UGL1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
KDM5BQ9UGL1 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC33.74■■■□□ 2.99
KDM5BQ9UGL1 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
KDM5BQ9UGL1 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
KDM5BQ9UGL1 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
KDM5BQ9UGL1 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
KDM5BQ9UGL1 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
KDM5BQ9UGL1 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
KDM5BQ9UGL1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
KDM5BQ9UGL1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
KDM5BQ9UGL1 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
KDM5BQ9UGL1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
KDM5BQ9UGL1 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
KDM5BQ9UGL1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
KDM5BQ9UGL1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
KDM5BQ9UGL1 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
KDM5BQ9UGL1 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
KDM5BQ9UGL1 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
KDM5BQ9UGL1 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
KDM5BQ9UGL1 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
KDM5BQ9UGL1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
KDM5BQ9UGL1 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
KDM5BQ9UGL1 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
KDM5BQ9UGL1 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC33.71■■■□□ 2.99
KDM5BQ9UGL1 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
KDM5BQ9UGL1 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
KDM5BQ9UGL1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
KDM5BQ9UGL1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
KDM5BQ9UGL1 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
KDM5BQ9UGL1 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
KDM5BQ9UGL1 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC33.7■■■□□ 2.99
KDM5BQ9UGL1 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
KDM5BQ9UGL1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC33.7■■■□□ 2.99
KDM5BQ9UGL1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
KDM5BQ9UGL1 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
KDM5BQ9UGL1 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
KDM5BQ9UGL1 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
KDM5BQ9UGL1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
KDM5BQ9UGL1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
KDM5BQ9UGL1 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
KDM5BQ9UGL1 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
KDM5BQ9UGL1 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
KDM5BQ9UGL1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
KDM5BQ9UGL1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
KDM5BQ9UGL1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
KDM5BQ9UGL1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
KDM5BQ9UGL1 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
KDM5BQ9UGL1 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
KDM5BQ9UGL1 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
KDM5BQ9UGL1 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
KDM5BQ9UGL1 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
KDM5BQ9UGL1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
KDM5BQ9UGL1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
KDM5BQ9UGL1 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
KDM5BQ9UGL1 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
KDM5BQ9UGL1 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
KDM5BQ9UGL1 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
KDM5BQ9UGL1 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
KDM5BQ9UGL1 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
KDM5BQ9UGL1 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
KDM5BQ9UGL1 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
KDM5BQ9UGL1 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
KDM5BQ9UGL1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
KDM5BQ9UGL1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
KDM5BQ9UGL1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
KDM5BQ9UGL1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
KDM5BQ9UGL1 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
KDM5BQ9UGL1 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
KDM5BQ9UGL1 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
KDM5BQ9UGL1 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms