Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DKK3Q9UBP4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DKK3Q9UBP4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DKK3Q9UBP4 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
DKK3Q9UBP4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
DKK3Q9UBP4 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
DKK3Q9UBP4 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DKK3Q9UBP4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DKK3Q9UBP4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DKK3Q9UBP4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DKK3Q9UBP4 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DKK3Q9UBP4 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
DKK3Q9UBP4 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DKK3Q9UBP4 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DKK3Q9UBP4 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DKK3Q9UBP4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DKK3Q9UBP4 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DKK3Q9UBP4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DKK3Q9UBP4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DKK3Q9UBP4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DKK3Q9UBP4 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DKK3Q9UBP4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DKK3Q9UBP4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DKK3Q9UBP4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DKK3Q9UBP4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DKK3Q9UBP4 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DKK3Q9UBP4 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DKK3Q9UBP4 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DKK3Q9UBP4 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DKK3Q9UBP4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
DKK3Q9UBP4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DKK3Q9UBP4 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DKK3Q9UBP4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DKK3Q9UBP4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DKK3Q9UBP4 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DKK3Q9UBP4 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DKK3Q9UBP4 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DKK3Q9UBP4 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DKK3Q9UBP4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DKK3Q9UBP4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DKK3Q9UBP4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DKK3Q9UBP4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DKK3Q9UBP4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DKK3Q9UBP4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DKK3Q9UBP4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DKK3Q9UBP4 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DKK3Q9UBP4 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DKK3Q9UBP4 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
DKK3Q9UBP4 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DKK3Q9UBP4 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DKK3Q9UBP4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
DKK3Q9UBP4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DKK3Q9UBP4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DKK3Q9UBP4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DKK3Q9UBP4 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DKK3Q9UBP4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DKK3Q9UBP4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
DKK3Q9UBP4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DKK3Q9UBP4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DKK3Q9UBP4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DKK3Q9UBP4 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DKK3Q9UBP4 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DKK3Q9UBP4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DKK3Q9UBP4 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DKK3Q9UBP4 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DKK3Q9UBP4 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
DKK3Q9UBP4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DKK3Q9UBP4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DKK3Q9UBP4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DKK3Q9UBP4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DKK3Q9UBP4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DKK3Q9UBP4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DKK3Q9UBP4 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DKK3Q9UBP4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DKK3Q9UBP4 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DKK3Q9UBP4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DKK3Q9UBP4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DKK3Q9UBP4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DKK3Q9UBP4 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DKK3Q9UBP4 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DKK3Q9UBP4 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DKK3Q9UBP4 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DKK3Q9UBP4 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DKK3Q9UBP4 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DKK3Q9UBP4 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DKK3Q9UBP4 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DKK3Q9UBP4 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DKK3Q9UBP4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DKK3Q9UBP4 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DKK3Q9UBP4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DKK3Q9UBP4 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DKK3Q9UBP4 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DKK3Q9UBP4 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
DKK3Q9UBP4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DKK3Q9UBP4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DKK3Q9UBP4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DKK3Q9UBP4 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DKK3Q9UBP4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
DKK3Q9UBP4 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DKK3Q9UBP4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102 ms