Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
XCL2Q9UBD3 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
XCL2Q9UBD3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
XCL2Q9UBD3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
XCL2Q9UBD3 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
XCL2Q9UBD3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
XCL2Q9UBD3 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
XCL2Q9UBD3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
XCL2Q9UBD3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
XCL2Q9UBD3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
XCL2Q9UBD3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
XCL2Q9UBD3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
XCL2Q9UBD3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
XCL2Q9UBD3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
XCL2Q9UBD3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
XCL2Q9UBD3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
XCL2Q9UBD3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
XCL2Q9UBD3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
XCL2Q9UBD3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
XCL2Q9UBD3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
XCL2Q9UBD3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
XCL2Q9UBD3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
XCL2Q9UBD3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
XCL2Q9UBD3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
XCL2Q9UBD3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
XCL2Q9UBD3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
XCL2Q9UBD3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
XCL2Q9UBD3 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
XCL2Q9UBD3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
XCL2Q9UBD3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
XCL2Q9UBD3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
XCL2Q9UBD3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
XCL2Q9UBD3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
XCL2Q9UBD3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
XCL2Q9UBD3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
XCL2Q9UBD3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
XCL2Q9UBD3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
XCL2Q9UBD3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
XCL2Q9UBD3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
XCL2Q9UBD3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
XCL2Q9UBD3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
XCL2Q9UBD3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
XCL2Q9UBD3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
XCL2Q9UBD3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
XCL2Q9UBD3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
XCL2Q9UBD3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
XCL2Q9UBD3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
XCL2Q9UBD3 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
XCL2Q9UBD3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
XCL2Q9UBD3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
XCL2Q9UBD3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
XCL2Q9UBD3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
XCL2Q9UBD3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
XCL2Q9UBD3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
XCL2Q9UBD3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
XCL2Q9UBD3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
XCL2Q9UBD3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
XCL2Q9UBD3 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
XCL2Q9UBD3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
XCL2Q9UBD3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
XCL2Q9UBD3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
XCL2Q9UBD3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
XCL2Q9UBD3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
XCL2Q9UBD3 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
XCL2Q9UBD3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
XCL2Q9UBD3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
XCL2Q9UBD3 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
XCL2Q9UBD3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
XCL2Q9UBD3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
XCL2Q9UBD3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
XCL2Q9UBD3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
XCL2Q9UBD3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
XCL2Q9UBD3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
XCL2Q9UBD3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
XCL2Q9UBD3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
XCL2Q9UBD3 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
XCL2Q9UBD3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
XCL2Q9UBD3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
XCL2Q9UBD3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
XCL2Q9UBD3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
XCL2Q9UBD3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
XCL2Q9UBD3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
XCL2Q9UBD3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
XCL2Q9UBD3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
XCL2Q9UBD3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
XCL2Q9UBD3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
XCL2Q9UBD3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
XCL2Q9UBD3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
XCL2Q9UBD3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
XCL2Q9UBD3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
XCL2Q9UBD3 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
XCL2Q9UBD3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
XCL2Q9UBD3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
XCL2Q9UBD3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
XCL2Q9UBD3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
XCL2Q9UBD3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
XCL2Q9UBD3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
XCL2Q9UBD3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
XCL2Q9UBD3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
XCL2Q9UBD3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms