Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZU7

CABP1, Calcium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP1Q9NZU7 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CABP1Q9NZU7 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CABP1Q9NZU7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CABP1Q9NZU7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CABP1Q9NZU7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CABP1Q9NZU7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CABP1Q9NZU7 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CABP1Q9NZU7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CABP1Q9NZU7 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CABP1Q9NZU7 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CABP1Q9NZU7 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CABP1Q9NZU7 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CABP1Q9NZU7 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
CABP1Q9NZU7 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CABP1Q9NZU7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CABP1Q9NZU7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CABP1Q9NZU7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CABP1Q9NZU7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CABP1Q9NZU7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CABP1Q9NZU7 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CABP1Q9NZU7 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CABP1Q9NZU7 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CABP1Q9NZU7 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CABP1Q9NZU7 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CABP1Q9NZU7 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CABP1Q9NZU7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CABP1Q9NZU7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CABP1Q9NZU7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CABP1Q9NZU7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CABP1Q9NZU7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
CABP1Q9NZU7 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CABP1Q9NZU7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CABP1Q9NZU7 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CABP1Q9NZU7 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CABP1Q9NZU7 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CABP1Q9NZU7 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CABP1Q9NZU7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
CABP1Q9NZU7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CABP1Q9NZU7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CABP1Q9NZU7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CABP1Q9NZU7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CABP1Q9NZU7 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CABP1Q9NZU7 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CABP1Q9NZU7 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CABP1Q9NZU7 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CABP1Q9NZU7 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CABP1Q9NZU7 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CABP1Q9NZU7 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CABP1Q9NZU7 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CABP1Q9NZU7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CABP1Q9NZU7 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CABP1Q9NZU7 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
CABP1Q9NZU7 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CABP1Q9NZU7 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CABP1Q9NZU7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CABP1Q9NZU7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CABP1Q9NZU7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CABP1Q9NZU7 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CABP1Q9NZU7 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CABP1Q9NZU7 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CABP1Q9NZU7 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CABP1Q9NZU7 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
CABP1Q9NZU7 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CABP1Q9NZU7 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CABP1Q9NZU7 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CABP1Q9NZU7 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CABP1Q9NZU7 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CABP1Q9NZU7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CABP1Q9NZU7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CABP1Q9NZU7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CABP1Q9NZU7 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
CABP1Q9NZU7 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
CABP1Q9NZU7 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
CABP1Q9NZU7 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CABP1Q9NZU7 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CABP1Q9NZU7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CABP1Q9NZU7 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CABP1Q9NZU7 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CABP1Q9NZU7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
CABP1Q9NZU7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CABP1Q9NZU7 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CABP1Q9NZU7 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CABP1Q9NZU7 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CABP1Q9NZU7 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CABP1Q9NZU7 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CABP1Q9NZU7 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CABP1Q9NZU7 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
CABP1Q9NZU7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CABP1Q9NZU7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CABP1Q9NZU7 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CABP1Q9NZU7 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CABP1Q9NZU7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CABP1Q9NZU7 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CABP1Q9NZU7 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CABP1Q9NZU7 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CABP1Q9NZU7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CABP1Q9NZU7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CABP1Q9NZU7 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CABP1Q9NZU7 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CABP1Q9NZU7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms