Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXL9

MCM9, DNA helicase MCM9, humanhuman

Predictions only

Length 1,143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM9Q9NXL9 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MCM9Q9NXL9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MCM9Q9NXL9 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
MCM9Q9NXL9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MCM9Q9NXL9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MCM9Q9NXL9 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MCM9Q9NXL9 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MCM9Q9NXL9 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MCM9Q9NXL9 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MCM9Q9NXL9 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MCM9Q9NXL9 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MCM9Q9NXL9 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MCM9Q9NXL9 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MCM9Q9NXL9 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MCM9Q9NXL9 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MCM9Q9NXL9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MCM9Q9NXL9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MCM9Q9NXL9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MCM9Q9NXL9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MCM9Q9NXL9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MCM9Q9NXL9 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MCM9Q9NXL9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MCM9Q9NXL9 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MCM9Q9NXL9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MCM9Q9NXL9 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MCM9Q9NXL9 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MCM9Q9NXL9 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MCM9Q9NXL9 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MCM9Q9NXL9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MCM9Q9NXL9 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MCM9Q9NXL9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MCM9Q9NXL9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
MCM9Q9NXL9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MCM9Q9NXL9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MCM9Q9NXL9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MCM9Q9NXL9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MCM9Q9NXL9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MCM9Q9NXL9 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MCM9Q9NXL9 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MCM9Q9NXL9 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MCM9Q9NXL9 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MCM9Q9NXL9 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MCM9Q9NXL9 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
MCM9Q9NXL9 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MCM9Q9NXL9 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MCM9Q9NXL9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MCM9Q9NXL9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MCM9Q9NXL9 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MCM9Q9NXL9 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MCM9Q9NXL9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MCM9Q9NXL9 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MCM9Q9NXL9 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MCM9Q9NXL9 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
MCM9Q9NXL9 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MCM9Q9NXL9 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MCM9Q9NXL9 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MCM9Q9NXL9 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MCM9Q9NXL9 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MCM9Q9NXL9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MCM9Q9NXL9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MCM9Q9NXL9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MCM9Q9NXL9 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MCM9Q9NXL9 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MCM9Q9NXL9 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MCM9Q9NXL9 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MCM9Q9NXL9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MCM9Q9NXL9 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MCM9Q9NXL9 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MCM9Q9NXL9 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MCM9Q9NXL9 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MCM9Q9NXL9 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
MCM9Q9NXL9 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MCM9Q9NXL9 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MCM9Q9NXL9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MCM9Q9NXL9 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
MCM9Q9NXL9 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MCM9Q9NXL9 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MCM9Q9NXL9 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
MCM9Q9NXL9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MCM9Q9NXL9 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MCM9Q9NXL9 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MCM9Q9NXL9 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MCM9Q9NXL9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MCM9Q9NXL9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MCM9Q9NXL9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MCM9Q9NXL9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MCM9Q9NXL9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MCM9Q9NXL9 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MCM9Q9NXL9 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MCM9Q9NXL9 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MCM9Q9NXL9 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MCM9Q9NXL9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MCM9Q9NXL9 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MCM9Q9NXL9 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MCM9Q9NXL9 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MCM9Q9NXL9 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MCM9Q9NXL9 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MCM9Q9NXL9 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MCM9Q9NXL9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MCM9Q9NXL9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms