Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW08

POLR3B, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3BQ9NW08 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR3BQ9NW08 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR3BQ9NW08 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR3BQ9NW08 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR3BQ9NW08 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR3BQ9NW08 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR3BQ9NW08 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR3BQ9NW08 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR3BQ9NW08 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR3BQ9NW08 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR3BQ9NW08 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR3BQ9NW08 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR3BQ9NW08 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR3BQ9NW08 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR3BQ9NW08 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR3BQ9NW08 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR3BQ9NW08 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR3BQ9NW08 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR3BQ9NW08 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR3BQ9NW08 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR3BQ9NW08 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR3BQ9NW08 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR3BQ9NW08 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR3BQ9NW08 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR3BQ9NW08 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR3BQ9NW08 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR3BQ9NW08 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR3BQ9NW08 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR3BQ9NW08 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR3BQ9NW08 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR3BQ9NW08 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR3BQ9NW08 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR3BQ9NW08 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR3BQ9NW08 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR3BQ9NW08 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR3BQ9NW08 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR3BQ9NW08 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR3BQ9NW08 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR3BQ9NW08 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR3BQ9NW08 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR3BQ9NW08 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR3BQ9NW08 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR3BQ9NW08 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR3BQ9NW08 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
POLR3BQ9NW08 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
POLR3BQ9NW08 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR3BQ9NW08 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR3BQ9NW08 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR3BQ9NW08 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR3BQ9NW08 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR3BQ9NW08 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR3BQ9NW08 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR3BQ9NW08 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR3BQ9NW08 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR3BQ9NW08 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR3BQ9NW08 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR3BQ9NW08 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR3BQ9NW08 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR3BQ9NW08 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR3BQ9NW08 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR3BQ9NW08 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLR3BQ9NW08 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLR3BQ9NW08 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
POLR3BQ9NW08 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLR3BQ9NW08 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
POLR3BQ9NW08 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLR3BQ9NW08 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLR3BQ9NW08 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLR3BQ9NW08 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
POLR3BQ9NW08 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLR3BQ9NW08 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
POLR3BQ9NW08 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLR3BQ9NW08 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
POLR3BQ9NW08 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3BQ9NW08 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3BQ9NW08 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3BQ9NW08 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3BQ9NW08 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3BQ9NW08 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3BQ9NW08 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3BQ9NW08 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3BQ9NW08 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3BQ9NW08 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3BQ9NW08 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3BQ9NW08 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3BQ9NW08 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3BQ9NW08 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3BQ9NW08 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3BQ9NW08 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3BQ9NW08 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3BQ9NW08 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR3BQ9NW08 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR3BQ9NW08 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR3BQ9NW08 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR3BQ9NW08 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR3BQ9NW08 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR3BQ9NW08 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR3BQ9NW08 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR3BQ9NW08 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR3BQ9NW08 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms