Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV88

INTS9, Integrator complex subunit 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS9Q9NV88 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
INTS9Q9NV88 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
INTS9Q9NV88 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
INTS9Q9NV88 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
INTS9Q9NV88 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
INTS9Q9NV88 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
INTS9Q9NV88 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
INTS9Q9NV88 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
INTS9Q9NV88 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
INTS9Q9NV88 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
INTS9Q9NV88 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
INTS9Q9NV88 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
INTS9Q9NV88 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
INTS9Q9NV88 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
INTS9Q9NV88 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
INTS9Q9NV88 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
INTS9Q9NV88 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
INTS9Q9NV88 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
INTS9Q9NV88 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
INTS9Q9NV88 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
INTS9Q9NV88 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
INTS9Q9NV88 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
INTS9Q9NV88 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
INTS9Q9NV88 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
INTS9Q9NV88 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
INTS9Q9NV88 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
INTS9Q9NV88 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
INTS9Q9NV88 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
INTS9Q9NV88 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
INTS9Q9NV88 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
INTS9Q9NV88 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
INTS9Q9NV88 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
INTS9Q9NV88 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
INTS9Q9NV88 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
INTS9Q9NV88 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
INTS9Q9NV88 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
INTS9Q9NV88 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
INTS9Q9NV88 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
INTS9Q9NV88 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
INTS9Q9NV88 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
INTS9Q9NV88 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
INTS9Q9NV88 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
INTS9Q9NV88 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
INTS9Q9NV88 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
INTS9Q9NV88 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
INTS9Q9NV88 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
INTS9Q9NV88 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
INTS9Q9NV88 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
INTS9Q9NV88 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
INTS9Q9NV88 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
INTS9Q9NV88 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
INTS9Q9NV88 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
INTS9Q9NV88 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
INTS9Q9NV88 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
INTS9Q9NV88 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
INTS9Q9NV88 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
INTS9Q9NV88 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
INTS9Q9NV88 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
INTS9Q9NV88 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
INTS9Q9NV88 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
INTS9Q9NV88 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
INTS9Q9NV88 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
INTS9Q9NV88 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
INTS9Q9NV88 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
INTS9Q9NV88 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
INTS9Q9NV88 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
INTS9Q9NV88 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
INTS9Q9NV88 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
INTS9Q9NV88 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
INTS9Q9NV88 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
INTS9Q9NV88 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
INTS9Q9NV88 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
INTS9Q9NV88 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
INTS9Q9NV88 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
INTS9Q9NV88 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
INTS9Q9NV88 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
INTS9Q9NV88 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
INTS9Q9NV88 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
INTS9Q9NV88 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
INTS9Q9NV88 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
INTS9Q9NV88 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
INTS9Q9NV88 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
INTS9Q9NV88 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
INTS9Q9NV88 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
INTS9Q9NV88 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
INTS9Q9NV88 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
INTS9Q9NV88 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
INTS9Q9NV88 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
INTS9Q9NV88 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
INTS9Q9NV88 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
INTS9Q9NV88 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
INTS9Q9NV88 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
INTS9Q9NV88 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
INTS9Q9NV88 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
INTS9Q9NV88 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
INTS9Q9NV88 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
INTS9Q9NV88 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
INTS9Q9NV88 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
INTS9Q9NV88 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
INTS9Q9NV88 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms