Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUV7

SPTLC3, Serine palmitoyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC3Q9NUV7 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPTLC3Q9NUV7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SPTLC3Q9NUV7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPTLC3Q9NUV7 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPTLC3Q9NUV7 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPTLC3Q9NUV7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPTLC3Q9NUV7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPTLC3Q9NUV7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPTLC3Q9NUV7 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPTLC3Q9NUV7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPTLC3Q9NUV7 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPTLC3Q9NUV7 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPTLC3Q9NUV7 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPTLC3Q9NUV7 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPTLC3Q9NUV7 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPTLC3Q9NUV7 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPTLC3Q9NUV7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPTLC3Q9NUV7 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPTLC3Q9NUV7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPTLC3Q9NUV7 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPTLC3Q9NUV7 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPTLC3Q9NUV7 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPTLC3Q9NUV7 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPTLC3Q9NUV7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SPTLC3Q9NUV7 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPTLC3Q9NUV7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPTLC3Q9NUV7 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPTLC3Q9NUV7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPTLC3Q9NUV7 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPTLC3Q9NUV7 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPTLC3Q9NUV7 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPTLC3Q9NUV7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPTLC3Q9NUV7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPTLC3Q9NUV7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SPTLC3Q9NUV7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPTLC3Q9NUV7 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPTLC3Q9NUV7 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPTLC3Q9NUV7 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPTLC3Q9NUV7 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPTLC3Q9NUV7 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPTLC3Q9NUV7 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPTLC3Q9NUV7 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPTLC3Q9NUV7 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPTLC3Q9NUV7 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPTLC3Q9NUV7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SPTLC3Q9NUV7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPTLC3Q9NUV7 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPTLC3Q9NUV7 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPTLC3Q9NUV7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPTLC3Q9NUV7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPTLC3Q9NUV7 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPTLC3Q9NUV7 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPTLC3Q9NUV7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPTLC3Q9NUV7 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPTLC3Q9NUV7 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPTLC3Q9NUV7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPTLC3Q9NUV7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPTLC3Q9NUV7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPTLC3Q9NUV7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPTLC3Q9NUV7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SPTLC3Q9NUV7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPTLC3Q9NUV7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SPTLC3Q9NUV7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPTLC3Q9NUV7 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPTLC3Q9NUV7 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPTLC3Q9NUV7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPTLC3Q9NUV7 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPTLC3Q9NUV7 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPTLC3Q9NUV7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPTLC3Q9NUV7 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPTLC3Q9NUV7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPTLC3Q9NUV7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPTLC3Q9NUV7 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPTLC3Q9NUV7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SPTLC3Q9NUV7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SPTLC3Q9NUV7 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPTLC3Q9NUV7 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPTLC3Q9NUV7 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPTLC3Q9NUV7 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPTLC3Q9NUV7 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPTLC3Q9NUV7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPTLC3Q9NUV7 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPTLC3Q9NUV7 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPTLC3Q9NUV7 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPTLC3Q9NUV7 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPTLC3Q9NUV7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPTLC3Q9NUV7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPTLC3Q9NUV7 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPTLC3Q9NUV7 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPTLC3Q9NUV7 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SPTLC3Q9NUV7 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPTLC3Q9NUV7 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPTLC3Q9NUV7 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPTLC3Q9NUV7 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPTLC3Q9NUV7 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPTLC3Q9NUV7 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPTLC3Q9NUV7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPTLC3Q9NUV7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPTLC3Q9NUV7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPTLC3Q9NUV7 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms