Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM4

TMEM106B, Transmembrane protein 106B, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106BQ9NUM4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEM106BQ9NUM4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM106BQ9NUM4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM106BQ9NUM4 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM106BQ9NUM4 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM106BQ9NUM4 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM106BQ9NUM4 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM106BQ9NUM4 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM106BQ9NUM4 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM106BQ9NUM4 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM106BQ9NUM4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM106BQ9NUM4 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM106BQ9NUM4 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM106BQ9NUM4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM106BQ9NUM4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM106BQ9NUM4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM106BQ9NUM4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM106BQ9NUM4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM106BQ9NUM4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM106BQ9NUM4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM106BQ9NUM4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM106BQ9NUM4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM106BQ9NUM4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM106BQ9NUM4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM106BQ9NUM4 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM106BQ9NUM4 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM106BQ9NUM4 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM106BQ9NUM4 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM106BQ9NUM4 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM106BQ9NUM4 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM106BQ9NUM4 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM106BQ9NUM4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM106BQ9NUM4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM106BQ9NUM4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM106BQ9NUM4 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM106BQ9NUM4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM106BQ9NUM4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM106BQ9NUM4 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM106BQ9NUM4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM106BQ9NUM4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM106BQ9NUM4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM106BQ9NUM4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM106BQ9NUM4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM106BQ9NUM4 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM106BQ9NUM4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM106BQ9NUM4 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM106BQ9NUM4 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM106BQ9NUM4 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM106BQ9NUM4 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM106BQ9NUM4 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM106BQ9NUM4 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM106BQ9NUM4 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM106BQ9NUM4 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM106BQ9NUM4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM106BQ9NUM4 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM106BQ9NUM4 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM106BQ9NUM4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM106BQ9NUM4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM106BQ9NUM4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM106BQ9NUM4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM106BQ9NUM4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM106BQ9NUM4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM106BQ9NUM4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM106BQ9NUM4 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM106BQ9NUM4 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM106BQ9NUM4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM106BQ9NUM4 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM106BQ9NUM4 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM106BQ9NUM4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM106BQ9NUM4 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM106BQ9NUM4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM106BQ9NUM4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM106BQ9NUM4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM106BQ9NUM4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM106BQ9NUM4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM106BQ9NUM4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM106BQ9NUM4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM106BQ9NUM4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM106BQ9NUM4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM106BQ9NUM4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM106BQ9NUM4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM106BQ9NUM4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM106BQ9NUM4 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM106BQ9NUM4 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM106BQ9NUM4 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM106BQ9NUM4 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM106BQ9NUM4 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM106BQ9NUM4 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM106BQ9NUM4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM106BQ9NUM4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM106BQ9NUM4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM106BQ9NUM4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM106BQ9NUM4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM106BQ9NUM4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM106BQ9NUM4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM106BQ9NUM4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM106BQ9NUM4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM106BQ9NUM4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM106BQ9NUM4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM106BQ9NUM4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms