Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUE0

ZDHHC18, Palmitoyltransferase ZDHHC18, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC18Q9NUE0 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZDHHC18Q9NUE0 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZDHHC18Q9NUE0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZDHHC18Q9NUE0 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZDHHC18Q9NUE0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZDHHC18Q9NUE0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZDHHC18Q9NUE0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZDHHC18Q9NUE0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZDHHC18Q9NUE0 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZDHHC18Q9NUE0 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZDHHC18Q9NUE0 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZDHHC18Q9NUE0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZDHHC18Q9NUE0 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZDHHC18Q9NUE0 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZDHHC18Q9NUE0 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZDHHC18Q9NUE0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZDHHC18Q9NUE0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZDHHC18Q9NUE0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZDHHC18Q9NUE0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ZDHHC18Q9NUE0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ZDHHC18Q9NUE0 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZDHHC18Q9NUE0 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZDHHC18Q9NUE0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZDHHC18Q9NUE0 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZDHHC18Q9NUE0 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZDHHC18Q9NUE0 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZDHHC18Q9NUE0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZDHHC18Q9NUE0 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZDHHC18Q9NUE0 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZDHHC18Q9NUE0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZDHHC18Q9NUE0 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZDHHC18Q9NUE0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZDHHC18Q9NUE0 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZDHHC18Q9NUE0 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZDHHC18Q9NUE0 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZDHHC18Q9NUE0 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZDHHC18Q9NUE0 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZDHHC18Q9NUE0 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZDHHC18Q9NUE0 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZDHHC18Q9NUE0 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZDHHC18Q9NUE0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZDHHC18Q9NUE0 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZDHHC18Q9NUE0 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZDHHC18Q9NUE0 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZDHHC18Q9NUE0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZDHHC18Q9NUE0 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZDHHC18Q9NUE0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZDHHC18Q9NUE0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZDHHC18Q9NUE0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ZDHHC18Q9NUE0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ZDHHC18Q9NUE0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ZDHHC18Q9NUE0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ZDHHC18Q9NUE0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ZDHHC18Q9NUE0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ZDHHC18Q9NUE0 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZDHHC18Q9NUE0 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZDHHC18Q9NUE0 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZDHHC18Q9NUE0 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZDHHC18Q9NUE0 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZDHHC18Q9NUE0 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZDHHC18Q9NUE0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZDHHC18Q9NUE0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZDHHC18Q9NUE0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZDHHC18Q9NUE0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZDHHC18Q9NUE0 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZDHHC18Q9NUE0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZDHHC18Q9NUE0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZDHHC18Q9NUE0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZDHHC18Q9NUE0 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZDHHC18Q9NUE0 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZDHHC18Q9NUE0 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZDHHC18Q9NUE0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZDHHC18Q9NUE0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZDHHC18Q9NUE0 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZDHHC18Q9NUE0 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZDHHC18Q9NUE0 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZDHHC18Q9NUE0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZDHHC18Q9NUE0 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZDHHC18Q9NUE0 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZDHHC18Q9NUE0 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZDHHC18Q9NUE0 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZDHHC18Q9NUE0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZDHHC18Q9NUE0 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZDHHC18Q9NUE0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZDHHC18Q9NUE0 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZDHHC18Q9NUE0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZDHHC18Q9NUE0 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZDHHC18Q9NUE0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZDHHC18Q9NUE0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ZDHHC18Q9NUE0 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZDHHC18Q9NUE0 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZDHHC18Q9NUE0 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZDHHC18Q9NUE0 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZDHHC18Q9NUE0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZDHHC18Q9NUE0 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZDHHC18Q9NUE0 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZDHHC18Q9NUE0 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZDHHC18Q9NUE0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZDHHC18Q9NUE0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZDHHC18Q9NUE0 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms