Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU39

FOXD4L1, Forkhead box protein D4-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L1Q9NU39 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FOXD4L1Q9NU39 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FOXD4L1Q9NU39 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FOXD4L1Q9NU39 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FOXD4L1Q9NU39 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FOXD4L1Q9NU39 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FOXD4L1Q9NU39 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FOXD4L1Q9NU39 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FOXD4L1Q9NU39 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FOXD4L1Q9NU39 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FOXD4L1Q9NU39 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FOXD4L1Q9NU39 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FOXD4L1Q9NU39 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FOXD4L1Q9NU39 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FOXD4L1Q9NU39 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FOXD4L1Q9NU39 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FOXD4L1Q9NU39 APOBEC3H-202ENST00000401756 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FOXD4L1Q9NU39 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FOXD4L1Q9NU39 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FOXD4L1Q9NU39 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FOXD4L1Q9NU39 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FOXD4L1Q9NU39 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FOXD4L1Q9NU39 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FOXD4L1Q9NU39 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FOXD4L1Q9NU39 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
FOXD4L1Q9NU39 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
FOXD4L1Q9NU39 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
FOXD4L1Q9NU39 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
FOXD4L1Q9NU39 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
FOXD4L1Q9NU39 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FOXD4L1Q9NU39 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FOXD4L1Q9NU39 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FOXD4L1Q9NU39 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
FOXD4L1Q9NU39 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FOXD4L1Q9NU39 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FOXD4L1Q9NU39 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FOXD4L1Q9NU39 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FOXD4L1Q9NU39 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FOXD4L1Q9NU39 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FOXD4L1Q9NU39 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FOXD4L1Q9NU39 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FOXD4L1Q9NU39 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FOXD4L1Q9NU39 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FOXD4L1Q9NU39 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FOXD4L1Q9NU39 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FOXD4L1Q9NU39 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FOXD4L1Q9NU39 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FOXD4L1Q9NU39 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FOXD4L1Q9NU39 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FOXD4L1Q9NU39 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FOXD4L1Q9NU39 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FOXD4L1Q9NU39 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FOXD4L1Q9NU39 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FOXD4L1Q9NU39 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FOXD4L1Q9NU39 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FOXD4L1Q9NU39 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FOXD4L1Q9NU39 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FOXD4L1Q9NU39 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FOXD4L1Q9NU39 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FOXD4L1Q9NU39 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FOXD4L1Q9NU39 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FOXD4L1Q9NU39 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FOXD4L1Q9NU39 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FOXD4L1Q9NU39 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FOXD4L1Q9NU39 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FOXD4L1Q9NU39 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
FOXD4L1Q9NU39 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FOXD4L1Q9NU39 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FOXD4L1Q9NU39 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
FOXD4L1Q9NU39 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FOXD4L1Q9NU39 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FOXD4L1Q9NU39 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FOXD4L1Q9NU39 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FOXD4L1Q9NU39 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FOXD4L1Q9NU39 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
FOXD4L1Q9NU39 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FOXD4L1Q9NU39 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FOXD4L1Q9NU39 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FOXD4L1Q9NU39 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FOXD4L1Q9NU39 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FOXD4L1Q9NU39 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FOXD4L1Q9NU39 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FOXD4L1Q9NU39 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FOXD4L1Q9NU39 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FOXD4L1Q9NU39 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
FOXD4L1Q9NU39 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FOXD4L1Q9NU39 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FOXD4L1Q9NU39 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FOXD4L1Q9NU39 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FOXD4L1Q9NU39 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FOXD4L1Q9NU39 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FOXD4L1Q9NU39 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FOXD4L1Q9NU39 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FOXD4L1Q9NU39 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FOXD4L1Q9NU39 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FOXD4L1Q9NU39 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FOXD4L1Q9NU39 AC092068.1-201ENST00000592525 454 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FOXD4L1Q9NU39 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FOXD4L1Q9NU39 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FOXD4L1Q9NU39 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms