Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT22

EMILIN3, EMILIN-3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN3Q9NT22 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EMILIN3Q9NT22 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EMILIN3Q9NT22 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EMILIN3Q9NT22 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EMILIN3Q9NT22 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EMILIN3Q9NT22 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EMILIN3Q9NT22 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EMILIN3Q9NT22 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EMILIN3Q9NT22 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EMILIN3Q9NT22 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EMILIN3Q9NT22 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EMILIN3Q9NT22 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EMILIN3Q9NT22 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EMILIN3Q9NT22 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EMILIN3Q9NT22 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EMILIN3Q9NT22 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EMILIN3Q9NT22 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EMILIN3Q9NT22 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EMILIN3Q9NT22 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EMILIN3Q9NT22 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EMILIN3Q9NT22 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EMILIN3Q9NT22 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EMILIN3Q9NT22 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EMILIN3Q9NT22 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EMILIN3Q9NT22 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EMILIN3Q9NT22 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EMILIN3Q9NT22 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EMILIN3Q9NT22 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EMILIN3Q9NT22 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EMILIN3Q9NT22 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EMILIN3Q9NT22 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EMILIN3Q9NT22 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EMILIN3Q9NT22 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EMILIN3Q9NT22 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EMILIN3Q9NT22 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EMILIN3Q9NT22 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EMILIN3Q9NT22 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EMILIN3Q9NT22 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EMILIN3Q9NT22 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
EMILIN3Q9NT22 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EMILIN3Q9NT22 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
EMILIN3Q9NT22 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
EMILIN3Q9NT22 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EMILIN3Q9NT22 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EMILIN3Q9NT22 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EMILIN3Q9NT22 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EMILIN3Q9NT22 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EMILIN3Q9NT22 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
EMILIN3Q9NT22 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EMILIN3Q9NT22 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EMILIN3Q9NT22 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EMILIN3Q9NT22 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EMILIN3Q9NT22 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EMILIN3Q9NT22 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EMILIN3Q9NT22 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EMILIN3Q9NT22 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EMILIN3Q9NT22 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EMILIN3Q9NT22 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EMILIN3Q9NT22 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
EMILIN3Q9NT22 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EMILIN3Q9NT22 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EMILIN3Q9NT22 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
EMILIN3Q9NT22 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EMILIN3Q9NT22 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EMILIN3Q9NT22 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EMILIN3Q9NT22 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EMILIN3Q9NT22 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EMILIN3Q9NT22 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EMILIN3Q9NT22 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EMILIN3Q9NT22 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EMILIN3Q9NT22 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EMILIN3Q9NT22 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EMILIN3Q9NT22 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EMILIN3Q9NT22 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EMILIN3Q9NT22 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EMILIN3Q9NT22 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EMILIN3Q9NT22 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EMILIN3Q9NT22 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EMILIN3Q9NT22 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EMILIN3Q9NT22 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
EMILIN3Q9NT22 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EMILIN3Q9NT22 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EMILIN3Q9NT22 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EMILIN3Q9NT22 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EMILIN3Q9NT22 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EMILIN3Q9NT22 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
EMILIN3Q9NT22 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EMILIN3Q9NT22 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EMILIN3Q9NT22 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
EMILIN3Q9NT22 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EMILIN3Q9NT22 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EMILIN3Q9NT22 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EMILIN3Q9NT22 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EMILIN3Q9NT22 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EMILIN3Q9NT22 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EMILIN3Q9NT22 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EMILIN3Q9NT22 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EMILIN3Q9NT22 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EMILIN3Q9NT22 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EMILIN3Q9NT22 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms