Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW7

VPS45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS45Q9NRW7 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VPS45Q9NRW7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VPS45Q9NRW7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VPS45Q9NRW7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VPS45Q9NRW7 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS45Q9NRW7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS45Q9NRW7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS45Q9NRW7 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS45Q9NRW7 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS45Q9NRW7 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS45Q9NRW7 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS45Q9NRW7 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS45Q9NRW7 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS45Q9NRW7 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS45Q9NRW7 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS45Q9NRW7 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS45Q9NRW7 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS45Q9NRW7 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS45Q9NRW7 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS45Q9NRW7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS45Q9NRW7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS45Q9NRW7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS45Q9NRW7 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS45Q9NRW7 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS45Q9NRW7 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS45Q9NRW7 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS45Q9NRW7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS45Q9NRW7 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS45Q9NRW7 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS45Q9NRW7 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS45Q9NRW7 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS45Q9NRW7 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS45Q9NRW7 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS45Q9NRW7 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS45Q9NRW7 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS45Q9NRW7 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS45Q9NRW7 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS45Q9NRW7 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS45Q9NRW7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS45Q9NRW7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS45Q9NRW7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS45Q9NRW7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS45Q9NRW7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS45Q9NRW7 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS45Q9NRW7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS45Q9NRW7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS45Q9NRW7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS45Q9NRW7 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS45Q9NRW7 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS45Q9NRW7 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS45Q9NRW7 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS45Q9NRW7 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS45Q9NRW7 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS45Q9NRW7 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS45Q9NRW7 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS45Q9NRW7 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS45Q9NRW7 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS45Q9NRW7 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS45Q9NRW7 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS45Q9NRW7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS45Q9NRW7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS45Q9NRW7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS45Q9NRW7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS45Q9NRW7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS45Q9NRW7 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS45Q9NRW7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS45Q9NRW7 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS45Q9NRW7 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS45Q9NRW7 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS45Q9NRW7 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS45Q9NRW7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS45Q9NRW7 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS45Q9NRW7 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS45Q9NRW7 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS45Q9NRW7 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS45Q9NRW7 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS45Q9NRW7 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS45Q9NRW7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS45Q9NRW7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS45Q9NRW7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS45Q9NRW7 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS45Q9NRW7 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS45Q9NRW7 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS45Q9NRW7 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS45Q9NRW7 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS45Q9NRW7 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS45Q9NRW7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS45Q9NRW7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS45Q9NRW7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS45Q9NRW7 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS45Q9NRW7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS45Q9NRW7 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS45Q9NRW7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS45Q9NRW7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS45Q9NRW7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS45Q9NRW7 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS45Q9NRW7 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS45Q9NRW7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS45Q9NRW7 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS45Q9NRW7 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms