Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR23

GDF3, Growth/differentiation factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF3Q9NR23 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GDF3Q9NR23 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GDF3Q9NR23 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GDF3Q9NR23 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GDF3Q9NR23 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GDF3Q9NR23 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GDF3Q9NR23 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GDF3Q9NR23 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GDF3Q9NR23 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GDF3Q9NR23 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GDF3Q9NR23 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GDF3Q9NR23 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GDF3Q9NR23 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GDF3Q9NR23 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GDF3Q9NR23 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GDF3Q9NR23 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GDF3Q9NR23 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GDF3Q9NR23 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GDF3Q9NR23 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GDF3Q9NR23 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GDF3Q9NR23 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GDF3Q9NR23 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GDF3Q9NR23 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GDF3Q9NR23 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GDF3Q9NR23 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GDF3Q9NR23 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GDF3Q9NR23 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GDF3Q9NR23 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GDF3Q9NR23 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GDF3Q9NR23 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GDF3Q9NR23 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GDF3Q9NR23 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GDF3Q9NR23 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GDF3Q9NR23 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GDF3Q9NR23 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GDF3Q9NR23 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GDF3Q9NR23 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GDF3Q9NR23 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GDF3Q9NR23 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GDF3Q9NR23 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GDF3Q9NR23 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GDF3Q9NR23 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GDF3Q9NR23 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GDF3Q9NR23 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GDF3Q9NR23 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GDF3Q9NR23 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GDF3Q9NR23 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GDF3Q9NR23 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GDF3Q9NR23 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GDF3Q9NR23 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GDF3Q9NR23 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GDF3Q9NR23 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GDF3Q9NR23 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GDF3Q9NR23 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GDF3Q9NR23 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GDF3Q9NR23 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GDF3Q9NR23 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GDF3Q9NR23 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GDF3Q9NR23 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GDF3Q9NR23 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GDF3Q9NR23 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GDF3Q9NR23 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GDF3Q9NR23 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GDF3Q9NR23 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GDF3Q9NR23 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GDF3Q9NR23 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GDF3Q9NR23 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GDF3Q9NR23 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GDF3Q9NR23 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GDF3Q9NR23 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GDF3Q9NR23 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GDF3Q9NR23 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GDF3Q9NR23 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GDF3Q9NR23 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GDF3Q9NR23 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GDF3Q9NR23 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GDF3Q9NR23 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GDF3Q9NR23 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GDF3Q9NR23 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GDF3Q9NR23 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GDF3Q9NR23 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GDF3Q9NR23 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GDF3Q9NR23 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GDF3Q9NR23 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GDF3Q9NR23 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GDF3Q9NR23 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GDF3Q9NR23 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GDF3Q9NR23 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GDF3Q9NR23 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GDF3Q9NR23 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GDF3Q9NR23 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GDF3Q9NR23 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GDF3Q9NR23 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GDF3Q9NR23 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GDF3Q9NR23 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GDF3Q9NR23 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GDF3Q9NR23 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GDF3Q9NR23 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GDF3Q9NR23 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GDF3Q9NR23 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms