Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC7

CYLD, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLDQ9NQC7 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYLDQ9NQC7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYLDQ9NQC7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYLDQ9NQC7 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYLDQ9NQC7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYLDQ9NQC7 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYLDQ9NQC7 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYLDQ9NQC7 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYLDQ9NQC7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CYLDQ9NQC7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYLDQ9NQC7 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYLDQ9NQC7 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYLDQ9NQC7 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYLDQ9NQC7 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYLDQ9NQC7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYLDQ9NQC7 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYLDQ9NQC7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYLDQ9NQC7 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYLDQ9NQC7 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYLDQ9NQC7 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYLDQ9NQC7 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYLDQ9NQC7 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CYLDQ9NQC7 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYLDQ9NQC7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYLDQ9NQC7 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYLDQ9NQC7 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYLDQ9NQC7 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYLDQ9NQC7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYLDQ9NQC7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYLDQ9NQC7 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYLDQ9NQC7 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYLDQ9NQC7 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYLDQ9NQC7 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYLDQ9NQC7 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CYLDQ9NQC7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYLDQ9NQC7 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYLDQ9NQC7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYLDQ9NQC7 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYLDQ9NQC7 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYLDQ9NQC7 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYLDQ9NQC7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYLDQ9NQC7 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CYLDQ9NQC7 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYLDQ9NQC7 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYLDQ9NQC7 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYLDQ9NQC7 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYLDQ9NQC7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYLDQ9NQC7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYLDQ9NQC7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYLDQ9NQC7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYLDQ9NQC7 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYLDQ9NQC7 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYLDQ9NQC7 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYLDQ9NQC7 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYLDQ9NQC7 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYLDQ9NQC7 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYLDQ9NQC7 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYLDQ9NQC7 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYLDQ9NQC7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYLDQ9NQC7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYLDQ9NQC7 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CYLDQ9NQC7 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CYLDQ9NQC7 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CYLDQ9NQC7 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYLDQ9NQC7 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYLDQ9NQC7 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYLDQ9NQC7 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYLDQ9NQC7 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYLDQ9NQC7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYLDQ9NQC7 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYLDQ9NQC7 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYLDQ9NQC7 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYLDQ9NQC7 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYLDQ9NQC7 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYLDQ9NQC7 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYLDQ9NQC7 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYLDQ9NQC7 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CYLDQ9NQC7 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYLDQ9NQC7 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYLDQ9NQC7 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYLDQ9NQC7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYLDQ9NQC7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYLDQ9NQC7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYLDQ9NQC7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYLDQ9NQC7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYLDQ9NQC7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYLDQ9NQC7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYLDQ9NQC7 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYLDQ9NQC7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYLDQ9NQC7 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYLDQ9NQC7 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYLDQ9NQC7 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYLDQ9NQC7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYLDQ9NQC7 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYLDQ9NQC7 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYLDQ9NQC7 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYLDQ9NQC7 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYLDQ9NQC7 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYLDQ9NQC7 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CYLDQ9NQC7 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms