Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ36

SCUBE2, Signal peptide, CUB and EGF-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCUBE2Q9NQ36 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCUBE2Q9NQ36 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCUBE2Q9NQ36 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCUBE2Q9NQ36 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCUBE2Q9NQ36 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCUBE2Q9NQ36 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCUBE2Q9NQ36 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCUBE2Q9NQ36 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCUBE2Q9NQ36 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SCUBE2Q9NQ36 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCUBE2Q9NQ36 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCUBE2Q9NQ36 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCUBE2Q9NQ36 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCUBE2Q9NQ36 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCUBE2Q9NQ36 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCUBE2Q9NQ36 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCUBE2Q9NQ36 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCUBE2Q9NQ36 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCUBE2Q9NQ36 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCUBE2Q9NQ36 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCUBE2Q9NQ36 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCUBE2Q9NQ36 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SCUBE2Q9NQ36 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCUBE2Q9NQ36 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCUBE2Q9NQ36 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCUBE2Q9NQ36 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCUBE2Q9NQ36 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCUBE2Q9NQ36 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCUBE2Q9NQ36 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCUBE2Q9NQ36 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCUBE2Q9NQ36 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCUBE2Q9NQ36 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCUBE2Q9NQ36 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCUBE2Q9NQ36 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCUBE2Q9NQ36 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCUBE2Q9NQ36 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCUBE2Q9NQ36 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCUBE2Q9NQ36 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCUBE2Q9NQ36 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCUBE2Q9NQ36 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCUBE2Q9NQ36 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCUBE2Q9NQ36 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCUBE2Q9NQ36 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCUBE2Q9NQ36 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCUBE2Q9NQ36 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCUBE2Q9NQ36 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCUBE2Q9NQ36 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCUBE2Q9NQ36 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCUBE2Q9NQ36 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCUBE2Q9NQ36 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCUBE2Q9NQ36 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCUBE2Q9NQ36 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCUBE2Q9NQ36 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCUBE2Q9NQ36 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCUBE2Q9NQ36 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCUBE2Q9NQ36 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCUBE2Q9NQ36 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCUBE2Q9NQ36 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SCUBE2Q9NQ36 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SCUBE2Q9NQ36 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCUBE2Q9NQ36 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCUBE2Q9NQ36 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCUBE2Q9NQ36 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SCUBE2Q9NQ36 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCUBE2Q9NQ36 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCUBE2Q9NQ36 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCUBE2Q9NQ36 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCUBE2Q9NQ36 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCUBE2Q9NQ36 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCUBE2Q9NQ36 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCUBE2Q9NQ36 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCUBE2Q9NQ36 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCUBE2Q9NQ36 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCUBE2Q9NQ36 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCUBE2Q9NQ36 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCUBE2Q9NQ36 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCUBE2Q9NQ36 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCUBE2Q9NQ36 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCUBE2Q9NQ36 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCUBE2Q9NQ36 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCUBE2Q9NQ36 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCUBE2Q9NQ36 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCUBE2Q9NQ36 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCUBE2Q9NQ36 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCUBE2Q9NQ36 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCUBE2Q9NQ36 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCUBE2Q9NQ36 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SCUBE2Q9NQ36 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCUBE2Q9NQ36 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCUBE2Q9NQ36 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCUBE2Q9NQ36 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCUBE2Q9NQ36 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCUBE2Q9NQ36 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCUBE2Q9NQ36 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCUBE2Q9NQ36 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCUBE2Q9NQ36 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCUBE2Q9NQ36 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SCUBE2Q9NQ36 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCUBE2Q9NQ36 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCUBE2Q9NQ36 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms