Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOBEC3GQ9HC16 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOBEC3GQ9HC16 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
APOBEC3GQ9HC16 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOBEC3GQ9HC16 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOBEC3GQ9HC16 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOBEC3GQ9HC16 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOBEC3GQ9HC16 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOBEC3GQ9HC16 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOBEC3GQ9HC16 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOBEC3GQ9HC16 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOBEC3GQ9HC16 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOBEC3GQ9HC16 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOBEC3GQ9HC16 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOBEC3GQ9HC16 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOBEC3GQ9HC16 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOBEC3GQ9HC16 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOBEC3GQ9HC16 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOBEC3GQ9HC16 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOBEC3GQ9HC16 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOBEC3GQ9HC16 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOBEC3GQ9HC16 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOBEC3GQ9HC16 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOBEC3GQ9HC16 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOBEC3GQ9HC16 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOBEC3GQ9HC16 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOBEC3GQ9HC16 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOBEC3GQ9HC16 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOBEC3GQ9HC16 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOBEC3GQ9HC16 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOBEC3GQ9HC16 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOBEC3GQ9HC16 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOBEC3GQ9HC16 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOBEC3GQ9HC16 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOBEC3GQ9HC16 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOBEC3GQ9HC16 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOBEC3GQ9HC16 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOBEC3GQ9HC16 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOBEC3GQ9HC16 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOBEC3GQ9HC16 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
APOBEC3GQ9HC16 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
APOBEC3GQ9HC16 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
APOBEC3GQ9HC16 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
APOBEC3GQ9HC16 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
APOBEC3GQ9HC16 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
APOBEC3GQ9HC16 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
APOBEC3GQ9HC16 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
APOBEC3GQ9HC16 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
APOBEC3GQ9HC16 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
APOBEC3GQ9HC16 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
APOBEC3GQ9HC16 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
APOBEC3GQ9HC16 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
APOBEC3GQ9HC16 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOBEC3GQ9HC16 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOBEC3GQ9HC16 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOBEC3GQ9HC16 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOBEC3GQ9HC16 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOBEC3GQ9HC16 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOBEC3GQ9HC16 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOBEC3GQ9HC16 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOBEC3GQ9HC16 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
APOBEC3GQ9HC16 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOBEC3GQ9HC16 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOBEC3GQ9HC16 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOBEC3GQ9HC16 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOBEC3GQ9HC16 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOBEC3GQ9HC16 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOBEC3GQ9HC16 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOBEC3GQ9HC16 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOBEC3GQ9HC16 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOBEC3GQ9HC16 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOBEC3GQ9HC16 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOBEC3GQ9HC16 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOBEC3GQ9HC16 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOBEC3GQ9HC16 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOBEC3GQ9HC16 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
APOBEC3GQ9HC16 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOBEC3GQ9HC16 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
APOBEC3GQ9HC16 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOBEC3GQ9HC16 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOBEC3GQ9HC16 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOBEC3GQ9HC16 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOBEC3GQ9HC16 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOBEC3GQ9HC16 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOBEC3GQ9HC16 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOBEC3GQ9HC16 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOBEC3GQ9HC16 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOBEC3GQ9HC16 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOBEC3GQ9HC16 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOBEC3GQ9HC16 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOBEC3GQ9HC16 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOBEC3GQ9HC16 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOBEC3GQ9HC16 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOBEC3GQ9HC16 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
APOBEC3GQ9HC16 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOBEC3GQ9HC16 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOBEC3GQ9HC16 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOBEC3GQ9HC16 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOBEC3GQ9HC16 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOBEC3GQ9HC16 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms