Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBG7

LY9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY9Q9HBG7 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LY9Q9HBG7 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
LY9Q9HBG7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LY9Q9HBG7 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
LY9Q9HBG7 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LY9Q9HBG7 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LY9Q9HBG7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LY9Q9HBG7 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LY9Q9HBG7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LY9Q9HBG7 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LY9Q9HBG7 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LY9Q9HBG7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LY9Q9HBG7 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LY9Q9HBG7 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LY9Q9HBG7 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LY9Q9HBG7 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LY9Q9HBG7 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LY9Q9HBG7 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LY9Q9HBG7 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LY9Q9HBG7 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LY9Q9HBG7 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LY9Q9HBG7 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LY9Q9HBG7 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LY9Q9HBG7 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LY9Q9HBG7 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LY9Q9HBG7 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LY9Q9HBG7 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LY9Q9HBG7 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LY9Q9HBG7 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LY9Q9HBG7 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
LY9Q9HBG7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LY9Q9HBG7 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LY9Q9HBG7 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LY9Q9HBG7 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LY9Q9HBG7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LY9Q9HBG7 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LY9Q9HBG7 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LY9Q9HBG7 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LY9Q9HBG7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LY9Q9HBG7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LY9Q9HBG7 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LY9Q9HBG7 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LY9Q9HBG7 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
LY9Q9HBG7 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LY9Q9HBG7 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LY9Q9HBG7 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LY9Q9HBG7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LY9Q9HBG7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LY9Q9HBG7 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LY9Q9HBG7 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
LY9Q9HBG7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LY9Q9HBG7 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LY9Q9HBG7 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LY9Q9HBG7 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LY9Q9HBG7 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LY9Q9HBG7 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LY9Q9HBG7 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LY9Q9HBG7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LY9Q9HBG7 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LY9Q9HBG7 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LY9Q9HBG7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LY9Q9HBG7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LY9Q9HBG7 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LY9Q9HBG7 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LY9Q9HBG7 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LY9Q9HBG7 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LY9Q9HBG7 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LY9Q9HBG7 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
LY9Q9HBG7 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LY9Q9HBG7 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LY9Q9HBG7 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
LY9Q9HBG7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LY9Q9HBG7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LY9Q9HBG7 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LY9Q9HBG7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LY9Q9HBG7 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LY9Q9HBG7 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LY9Q9HBG7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LY9Q9HBG7 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LY9Q9HBG7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LY9Q9HBG7 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LY9Q9HBG7 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LY9Q9HBG7 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LY9Q9HBG7 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
LY9Q9HBG7 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LY9Q9HBG7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LY9Q9HBG7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LY9Q9HBG7 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
LY9Q9HBG7 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LY9Q9HBG7 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LY9Q9HBG7 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LY9Q9HBG7 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
LY9Q9HBG7 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LY9Q9HBG7 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LY9Q9HBG7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LY9Q9HBG7 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LY9Q9HBG7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LY9Q9HBG7 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LY9Q9HBG7 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
LY9Q9HBG7 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms