Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAB3

SLC52A2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A2Q9HAB3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLC52A2Q9HAB3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLC52A2Q9HAB3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLC52A2Q9HAB3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC52A2Q9HAB3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC52A2Q9HAB3 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC52A2Q9HAB3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC52A2Q9HAB3 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC52A2Q9HAB3 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC52A2Q9HAB3 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC52A2Q9HAB3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC52A2Q9HAB3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC52A2Q9HAB3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC52A2Q9HAB3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
SLC52A2Q9HAB3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
SLC52A2Q9HAB3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
SLC52A2Q9HAB3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
SLC52A2Q9HAB3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
SLC52A2Q9HAB3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC52A2Q9HAB3 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC52A2Q9HAB3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC52A2Q9HAB3 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC52A2Q9HAB3 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC52A2Q9HAB3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC52A2Q9HAB3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC52A2Q9HAB3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC52A2Q9HAB3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC52A2Q9HAB3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC52A2Q9HAB3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC52A2Q9HAB3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC52A2Q9HAB3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC52A2Q9HAB3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC52A2Q9HAB3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC52A2Q9HAB3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC52A2Q9HAB3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC52A2Q9HAB3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC52A2Q9HAB3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC52A2Q9HAB3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC52A2Q9HAB3 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC52A2Q9HAB3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC52A2Q9HAB3 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC52A2Q9HAB3 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC52A2Q9HAB3 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC52A2Q9HAB3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC52A2Q9HAB3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC52A2Q9HAB3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC52A2Q9HAB3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC52A2Q9HAB3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC52A2Q9HAB3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC52A2Q9HAB3 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC52A2Q9HAB3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC52A2Q9HAB3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC52A2Q9HAB3 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC52A2Q9HAB3 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC52A2Q9HAB3 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC52A2Q9HAB3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC52A2Q9HAB3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC52A2Q9HAB3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC52A2Q9HAB3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC52A2Q9HAB3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC52A2Q9HAB3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC52A2Q9HAB3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC52A2Q9HAB3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC52A2Q9HAB3 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC52A2Q9HAB3 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC52A2Q9HAB3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC52A2Q9HAB3 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC52A2Q9HAB3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC52A2Q9HAB3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC52A2Q9HAB3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC52A2Q9HAB3 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC52A2Q9HAB3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC52A2Q9HAB3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC52A2Q9HAB3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC52A2Q9HAB3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC52A2Q9HAB3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC52A2Q9HAB3 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC52A2Q9HAB3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC52A2Q9HAB3 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC52A2Q9HAB3 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC52A2Q9HAB3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC52A2Q9HAB3 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC52A2Q9HAB3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC52A2Q9HAB3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC52A2Q9HAB3 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC52A2Q9HAB3 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC52A2Q9HAB3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC52A2Q9HAB3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC52A2Q9HAB3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC52A2Q9HAB3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SLC52A2Q9HAB3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SLC52A2Q9HAB3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SLC52A2Q9HAB3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SLC52A2Q9HAB3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SLC52A2Q9HAB3 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
SLC52A2Q9HAB3 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SLC52A2Q9HAB3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SLC52A2Q9HAB3 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
SLC52A2Q9HAB3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC52A2Q9HAB3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms