Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7E2

TDRD3, Tudor domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 651 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD3Q9H7E2 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TDRD3Q9H7E2 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TDRD3Q9H7E2 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TDRD3Q9H7E2 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TDRD3Q9H7E2 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TDRD3Q9H7E2 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TDRD3Q9H7E2 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TDRD3Q9H7E2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TDRD3Q9H7E2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TDRD3Q9H7E2 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TDRD3Q9H7E2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TDRD3Q9H7E2 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TDRD3Q9H7E2 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TDRD3Q9H7E2 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TDRD3Q9H7E2 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TDRD3Q9H7E2 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TDRD3Q9H7E2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TDRD3Q9H7E2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TDRD3Q9H7E2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TDRD3Q9H7E2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TDRD3Q9H7E2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TDRD3Q9H7E2 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TDRD3Q9H7E2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TDRD3Q9H7E2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TDRD3Q9H7E2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TDRD3Q9H7E2 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TDRD3Q9H7E2 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TDRD3Q9H7E2 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TDRD3Q9H7E2 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TDRD3Q9H7E2 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TDRD3Q9H7E2 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TDRD3Q9H7E2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TDRD3Q9H7E2 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TDRD3Q9H7E2 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TDRD3Q9H7E2 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TDRD3Q9H7E2 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TDRD3Q9H7E2 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TDRD3Q9H7E2 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TDRD3Q9H7E2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TDRD3Q9H7E2 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TDRD3Q9H7E2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TDRD3Q9H7E2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TDRD3Q9H7E2 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TDRD3Q9H7E2 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TDRD3Q9H7E2 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TDRD3Q9H7E2 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TDRD3Q9H7E2 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TDRD3Q9H7E2 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TDRD3Q9H7E2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TDRD3Q9H7E2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TDRD3Q9H7E2 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TDRD3Q9H7E2 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TDRD3Q9H7E2 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TDRD3Q9H7E2 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TDRD3Q9H7E2 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TDRD3Q9H7E2 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TDRD3Q9H7E2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TDRD3Q9H7E2 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TDRD3Q9H7E2 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TDRD3Q9H7E2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TDRD3Q9H7E2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TDRD3Q9H7E2 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TDRD3Q9H7E2 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TDRD3Q9H7E2 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TDRD3Q9H7E2 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TDRD3Q9H7E2 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TDRD3Q9H7E2 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TDRD3Q9H7E2 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TDRD3Q9H7E2 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TDRD3Q9H7E2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TDRD3Q9H7E2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TDRD3Q9H7E2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TDRD3Q9H7E2 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TDRD3Q9H7E2 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TDRD3Q9H7E2 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TDRD3Q9H7E2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TDRD3Q9H7E2 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TDRD3Q9H7E2 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TDRD3Q9H7E2 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TDRD3Q9H7E2 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TDRD3Q9H7E2 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TDRD3Q9H7E2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TDRD3Q9H7E2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TDRD3Q9H7E2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TDRD3Q9H7E2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TDRD3Q9H7E2 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TDRD3Q9H7E2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TDRD3Q9H7E2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TDRD3Q9H7E2 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TDRD3Q9H7E2 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TDRD3Q9H7E2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TDRD3Q9H7E2 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TDRD3Q9H7E2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TDRD3Q9H7E2 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TDRD3Q9H7E2 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TDRD3Q9H7E2 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TDRD3Q9H7E2 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TDRD3Q9H7E2 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TDRD3Q9H7E2 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TDRD3Q9H7E2 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
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