Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4W6

EBF3, Transcription factor COE3, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF3Q9H4W6 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EBF3Q9H4W6 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EBF3Q9H4W6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EBF3Q9H4W6 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EBF3Q9H4W6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EBF3Q9H4W6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EBF3Q9H4W6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EBF3Q9H4W6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EBF3Q9H4W6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EBF3Q9H4W6 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
EBF3Q9H4W6 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EBF3Q9H4W6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EBF3Q9H4W6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EBF3Q9H4W6 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EBF3Q9H4W6 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EBF3Q9H4W6 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
EBF3Q9H4W6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EBF3Q9H4W6 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EBF3Q9H4W6 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EBF3Q9H4W6 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EBF3Q9H4W6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EBF3Q9H4W6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EBF3Q9H4W6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EBF3Q9H4W6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EBF3Q9H4W6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EBF3Q9H4W6 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EBF3Q9H4W6 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EBF3Q9H4W6 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EBF3Q9H4W6 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EBF3Q9H4W6 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EBF3Q9H4W6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EBF3Q9H4W6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
EBF3Q9H4W6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EBF3Q9H4W6 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EBF3Q9H4W6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EBF3Q9H4W6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EBF3Q9H4W6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EBF3Q9H4W6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EBF3Q9H4W6 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EBF3Q9H4W6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
EBF3Q9H4W6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EBF3Q9H4W6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EBF3Q9H4W6 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EBF3Q9H4W6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EBF3Q9H4W6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EBF3Q9H4W6 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EBF3Q9H4W6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EBF3Q9H4W6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EBF3Q9H4W6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EBF3Q9H4W6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EBF3Q9H4W6 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EBF3Q9H4W6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
EBF3Q9H4W6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EBF3Q9H4W6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EBF3Q9H4W6 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
EBF3Q9H4W6 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EBF3Q9H4W6 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EBF3Q9H4W6 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EBF3Q9H4W6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
EBF3Q9H4W6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EBF3Q9H4W6 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EBF3Q9H4W6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EBF3Q9H4W6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EBF3Q9H4W6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EBF3Q9H4W6 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EBF3Q9H4W6 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EBF3Q9H4W6 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EBF3Q9H4W6 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EBF3Q9H4W6 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
EBF3Q9H4W6 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EBF3Q9H4W6 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
EBF3Q9H4W6 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EBF3Q9H4W6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EBF3Q9H4W6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EBF3Q9H4W6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EBF3Q9H4W6 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EBF3Q9H4W6 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EBF3Q9H4W6 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EBF3Q9H4W6 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EBF3Q9H4W6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EBF3Q9H4W6 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EBF3Q9H4W6 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EBF3Q9H4W6 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EBF3Q9H4W6 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EBF3Q9H4W6 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EBF3Q9H4W6 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EBF3Q9H4W6 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EBF3Q9H4W6 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
EBF3Q9H4W6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EBF3Q9H4W6 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EBF3Q9H4W6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EBF3Q9H4W6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EBF3Q9H4W6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EBF3Q9H4W6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EBF3Q9H4W6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EBF3Q9H4W6 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EBF3Q9H4W6 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EBF3Q9H4W6 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EBF3Q9H4W6 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
EBF3Q9H4W6 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms